85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0853 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 274 aa  533  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  57.3 
 
 		 266 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  57.3 
 
 		 266 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  46.33 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  50.58 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5261  putative transmembrane anti-sigma factor  49.42 
 
 		 268 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2754  putative transmembrane anti-sigma factor  43.07 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  37.35 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2466  hypothetical protein  41.7 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1209  anti-sigma factor  39.62 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1310  hypothetical protein  40.68 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  42.29 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2549  putative transmembrane transcriptional regulator  36.33 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0522  hypothetical protein  39.69 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3279  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.07 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  35.84 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4979  putative transmembrane anti-sigma factor  35.84 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0783383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1708  putative transmembrane anti-sigma factor  39.3 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2555  putative transmembrane anti-sigma factor  36.53 
 
 		 279 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00539506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2782  putative transmembrane anti-sigma factor  36.19 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.826576  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3260  putative transmembrane anti-sigma factor  36.43 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760903  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3001  putative transmembrane anti-sigma factor  39.31 
 
 		 279 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  34.87 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1998  putative transmembrane anti-sigma factor  37.92 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.706225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0229  hypothetical protein  38.28 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0298  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0145  putative transmembrane anti-sigma factor  40.15 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.617823  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0173  putative transmembrane anti-sigma factor  37.5 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.365386  normal  0.0709192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2913  putative transmembrane anti-sigma factor  35.05 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0019  putative transmembrane anti-sigma factor  31.14 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.836012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  38.11 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000249253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1653  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  39.62 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000192348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2783  putative transmembrane transcriptional regulator(anti-sigma factor) protein, PrtR  48.23 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1253  putative transmembrane anti-sigma factor  36.16 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0479785  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3377  putative transmembrane anti-sigma factor  38.52 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1667  putative transmembrane anti-sigma factor  46.81 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2523  putative transmembrane anti-sigma factor  36.19 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.690899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2982  hypothetical protein  36.99 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3398  putative transmembrane anti-sigma factor  35.98 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.745464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3944  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  37.85 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00740335  normal  0.0369582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1386  hypothetical protein  34.1 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0048642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1501  hypothetical protein  36.17 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1186  hypothetical protein  33.59 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128596  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  33.97 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0015  hypothetical protein  43.64 
 
 		 495 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0826  putative transmembrane anti-sigma factor  36.65 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00528212  hitchhiker  0.000460261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  35.18 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  35.18 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1414  hypothetical protein  43.64 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142705  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  35.18 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1155  hypothetical protein  38.06 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0424  hypothetical protein  38.06 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.365685  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0145  hypothetical protein  38.06 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0855  putative transmembrane anti-sigma factor  34.22 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3667  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma-factor)  30.45 
 
 		 250 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0745  putative transmembrane anti-sigma factor  34.91 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0728  putative transmembrane anti-sigma factor  47 
 
 		 261 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3785  putative transmembrane anti-sigma factor  33.57 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2533  putative transmembrane anti-sigma factor  35.34 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420248  normal  0.0303873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  33.65 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00133889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0008  putative transmembrane anti-sigma factor  32.31 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0009  putative transmembrane anti-sigma factor  31.69 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0293  transmembrane regulator PrtR  34.43 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000206398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0083  transmembrane regulator PrtR  34.43 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0083  transmembrane regulator PrtR  34.02 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0373  putative transmembrane anti-sigma factor  41.82 
 
 		 126 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0070  transmembrane regulator PrtR  31.97 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  28.73 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15965 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2392  putative transmembrane anti-sigma factor  29.46 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2889  putative transmembrane anti-sigma factor  30.74 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00655403  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3067  putative transmembrane anti-sigma factor  27.76 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0599961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2801  putative transmembrane anti-sigma factor  30.33 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.261643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  39.26 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  29.52 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  25.37 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  37.78 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2893  putative transmembrane anti-sigma factor  28.93 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2803  putative transmembrane anti-sigma factor  27.1 
 
 		 280 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0342001 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  32.11 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  46.77 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1005  putative transmembrane anti-sigma factor  43.42 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368006 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  46.67 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0017  putative transmembrane anti-sigma factor  38.71 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.481233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1105  putative transmembrane anti-sigma factor  39.39 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>