More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0835 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  80.09 
 
 		 243 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  60.76 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  61.78 
 
 		 239 aa  291  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  60.89 
 
 		 237 aa  291  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  60.89 
 
 		 237 aa  291  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  60.89 
 
 		 237 aa  288  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  59.11 
 
 		 239 aa  278  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  53.12 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  53.12 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  54.26 
 
 		 238 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  53.81 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  52.47 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  53.36 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  52.47 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  52.47 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  54.71 
 
 		 240 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  54.71 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  54.71 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  56.19 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  54.5 
 
 		 237 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  53.6 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  53.15 
 
 		 237 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  52.23 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.22 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.9 
 
 		 240 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  47.77 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  46.19 
 
 		 243 aa  208  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  45.18 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  43.95 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  44.49 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  46.22 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  44.25 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  44.89 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  44.14 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.05 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  43.69 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  43.69 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  41.96 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  41.18 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  47.73 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.44 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  43.89 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  43.89 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  40.71 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  41.4 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  39.64 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.62 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  40.74 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  39.44 
 
 		 237 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.51 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  40.09 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  40.09 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  40.19 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  38.6 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  39.07 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  38.14 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  40.65 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  40.65 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 		 256 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  39.72 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  40.65 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  40.77 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  37.09 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  39.04 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  39.35 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  35.68 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  36.15 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  36.15 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  39.83 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  36.62 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  36.62 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  39.09 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  36.62 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  40.74 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  41.36 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  41.74 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  36.62 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  40.47 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  39.42 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  39.92 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  39.5 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  35.68 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  35.68 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  41.01 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  35.68 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  35.68 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  35.68 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>