More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0831 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 317 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  75.25 
 
 		 314 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  75.08 
 
 		 319 aa  484  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  74.59 
 
 		 314 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  72.88 
 
 		 316 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  71.9 
 
 		 330 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  71.9 
 
 		 316 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  73.11 
 
 		 309 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  72 
 
 		 309 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  72 
 
 		 308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  70.63 
 
 		 308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  73.93 
 
 		 326 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  69.97 
 
 		 328 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  69.08 
 
 		 316 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  66.67 
 
 		 310 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  69 
 
 		 308 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  64.63 
 
 		 313 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  63.93 
 
 		 312 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  63.93 
 
 		 312 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  63.49 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  62.58 
 
 		 304 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  62.91 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  62.13 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  59.93 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  61.72 
 
 		 308 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  59.33 
 
 		 305 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  57.05 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  58.58 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  56.58 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  364  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  58.03 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  55.41 
 
 		 311 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  55.59 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  54.13 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  53.47 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  51.35 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  47.06 
 
 		 303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 298 aa  305  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.04 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  49.16 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 		 305 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 		 305 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  47.49 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  47.27 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 302 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  49.82 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  46.05 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  44.76 
 
 		 316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.76 
 
 		 316 aa  288  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  46.2 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  47.18 
 
 		 306 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  43.77 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  45.79 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  47.02 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  44.13 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.35 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  47.84 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.81 
 
 		 316 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 309 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 309 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  46.51 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>