More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0786 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 333 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  79.28 
 
 		 333 aa  529  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.91 
 
 		 336 aa  484  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  70.21 
 
 		 336 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  70.21 
 
 		 336 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  71.69 
 
 		 337 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  70.09 
 
 		 336 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.38 
 
 		 334 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  72.51 
 
 		 333 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.58 
 
 		 336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  70.87 
 
 		 334 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  69.94 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  70.66 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  69.85 
 
 		 332 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  68.92 
 
 		 334 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  70.77 
 
 		 334 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  69.65 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  69.01 
 
 		 335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  69.65 
 
 		 335 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  66.56 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  70.78 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  69.13 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  69.3 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.58 
 
 		 336 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65 
 
 		 336 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  64.31 
 
 		 343 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  67.19 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  63.21 
 
 		 332 aa  417  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  65.27 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  64.84 
 
 		 335 aa  407  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  63.67 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  62.46 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  63.67 
 
 		 338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.5 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  63.78 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  62.38 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  65.72 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.29 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.86 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  49.5 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.72 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  49.03 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  51 
 
 		 321 aa  315  8e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  52.12 
 
 		 338 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  52.82 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.16 
 
 		 341 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.86 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.82 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.98 
 
 		 351 aa  299  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.96 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 334 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.4 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.51 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.45 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  49.67 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.33 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  46.71 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  49.49 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  45.81 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.51 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.62 
 
 		 313 aa  275  8e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  43.85 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.13 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  46.56 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.06 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.05 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  44.7 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.23 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  41.07 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  42.19 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.74 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.3 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  42.52 
 
 		 340 aa  248  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  42.47 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  38.01 
 
 		 329 aa  247  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.75 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  44.3 
 
 		 371 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  43.06 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.65 
 
 		 328 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  40 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  40.32 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  40.43 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  42.33 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  39.74 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.31 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  41.92 
 
 		 370 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  42.59 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  43.05 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  41.39 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.69 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  43.63 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.48 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  42.02 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  41.69 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.08 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  41.1 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.59 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  44.01 
 
 		 353 aa  232  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>