More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0777 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  77.1 
 
 
446 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  73.87 
 
 
449 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  75.93 
 
 
446 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  71.85 
 
 
450 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  75.06 
 
 
446 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  71.65 
 
 
448 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  72.75 
 
 
450 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  73.84 
 
 
447 aa  659    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  73.12 
 
 
450 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  73.3 
 
 
450 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  81.36 
 
 
451 aa  738    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  71.21 
 
 
448 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  76.64 
 
 
446 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  71.3 
 
 
466 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
449 aa  902    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  75.93 
 
 
446 aa  670    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  68.22 
 
 
451 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  68.22 
 
 
450 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  68.22 
 
 
450 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  67.78 
 
 
450 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 
451 aa  611  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 
451 aa  611  9.999999999999999e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  66.22 
 
 
459 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  67.12 
 
 
465 aa  607  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  65.55 
 
 
448 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  66 
 
 
445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  63.37 
 
 
450 aa  568  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  63.31 
 
 
445 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  62.81 
 
 
456 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  61.26 
 
 
452 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  61.04 
 
 
448 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  57.91 
 
 
452 aa  525  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  60.54 
 
 
444 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  57.74 
 
 
447 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  57.05 
 
 
449 aa  505  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  56.25 
 
 
447 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  58.13 
 
 
447 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  57.68 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  57.46 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  56.4 
 
 
447 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  54.48 
 
 
483 aa  484  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  57.57 
 
 
447 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  52.02 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  52.93 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  52.14 
 
 
451 aa  441  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  50.79 
 
 
454 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  51.02 
 
 
454 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  51 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
454 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 
469 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  51.35 
 
 
453 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
450 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  48.89 
 
 
450 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 
496 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
450 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  51.5 
 
 
496 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  50.57 
 
 
449 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  48 
 
 
450 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  49.56 
 
 
450 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  50.91 
 
 
458 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
446 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  50.44 
 
 
446 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  46.85 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  47.8 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  46.21 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0202  phosphoglucosamine mutase  48.64 
 
 
459 aa  402  1e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 
448 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  47.74 
 
 
445 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 
448 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 
448 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 
448 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  47.95 
 
 
455 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  47.95 
 
 
455 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 
448 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 
448 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  45.98 
 
 
448 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  47.58 
 
 
446 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  48.98 
 
 
444 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  45.7 
 
 
449 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  48.31 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  48.44 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  45.76 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  45.76 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  51.76 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  51.76 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  45.76 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.24 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  48 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  47.81 
 
 
447 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  47.98 
 
 
444 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1738  phosphoglucosamine mutase  50.67 
 
 
450 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  48.11 
 
 
455 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1484  phosphoglucosamine mutase  49.19 
 
 
452 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  49 
 
 
447 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  46.86 
 
 
446 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0946  phosphoglucosamine mutase  48.24 
 
 
450 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1617  phosphoglucosamine mutase  48.96 
 
 
452 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.953372  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1789  phosphoglucosamine mutase  47.05 
 
 
446 aa  394  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0573  phosphoglucosamine mutase  48.96 
 
 
467 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0578  phosphoglucosamine mutase  48.96 
 
 
452 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>