71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0771 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
481 aa  951  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  46.44 
 
 
485 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  47.43 
 
 
454 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 
478 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  45.24 
 
 
478 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  43.04 
 
 
499 aa  342  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  37.5 
 
 
482 aa  285  1e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  34.71 
 
 
466 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.91 
 
 
460 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.91 
 
 
460 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  37.82 
 
 
460 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  33.76 
 
 
467 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  34.93 
 
 
474 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  34.04 
 
 
467 aa  222  1e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  37.37 
 
 
462 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 
453 aa  215  1e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
523 aa  215  2e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  34.41 
 
 
455 aa  214  3e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  34.04 
 
 
469 aa  214  3e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  33.83 
 
 
469 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
455 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  32.91 
 
 
471 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  202  1e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  33.4 
 
 
474 aa  202  2e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  33.12 
 
 
445 aa  201  2e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  34.05 
 
 
470 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.2 
 
 
468 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  31.22 
 
 
465 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  31.7 
 
 
444 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  32.83 
 
 
466 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  31.58 
 
 
473 aa  187  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  32.53 
 
 
442 aa  186  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  31.51 
 
 
471 aa  186  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  32.83 
 
 
466 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  32.83 
 
 
466 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  32.83 
 
 
466 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  32.83 
 
 
466 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  32.83 
 
 
466 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.43 
 
 
443 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  33.61 
 
 
473 aa  181  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.05 
 
 
475 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  33.48 
 
 
464 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.83 
 
 
455 aa  173  7e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  30.57 
 
 
456 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  30.46 
 
 
453 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  35.78 
 
 
1751 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  30.36 
 
 
470 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  27.94 
 
 
479 aa  154  3e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.15 
 
 
883 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  26.53 
 
 
468 aa  135  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
480 aa  128  2e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  26.29 
 
 
468 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  24.95 
 
 
466 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.52 
 
 
506 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  27.98 
 
 
490 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  24.63 
 
 
458 aa  84  6e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  26.77 
 
 
633 aa  77  6e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  28.45 
 
 
507 aa  72.8  1e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  32.21 
 
 
477 aa  70.9  5e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.35 
 
 
500 aa  65.5  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.35 
 
 
500 aa  65.5  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.31 
 
 
608 aa  62  2e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  20 
 
 
494 aa  59.7  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4223  hypothetical protein  30.61 
 
 
125 aa  53.5  9e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284789  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  23.63 
 
 
615 aa  50.1  9e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  28.95 
 
 
483 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  41.79 
 
 
239 aa  47  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  25.93 
 
 
534 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 
479 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  26.94 
 
 
534 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  23.21 
 
 
472 aa  44.3  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>