More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0764 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0764  aldo/keto reductase  100 
 
 
288 aa  584  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0414529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0104  aldo/keto reductase  67.47 
 
 
293 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0114  aldo/keto reductase  67.83 
 
 
293 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1685  aldo/keto reductase  66.78 
 
 
300 aa  398  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5154  aldo/keto reductase  64.34 
 
 
292 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4689  aldo/keto reductase  64.34 
 
 
292 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5232  aldo/keto reductase  65.12 
 
 
292 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109633  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2191  aldo/keto reductase  64.11 
 
 
296 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.41887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  64.34 
 
 
291 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0033  aldo/keto reductase  64.06 
 
 
289 aa  377  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5322  aldo/keto reductase  66.18 
 
 
293 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0362532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2941  aldo/keto reductase  62.99 
 
 
284 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3009  aldo/keto reductase  64.54 
 
 
285 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0466908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3682  aldo/keto reductase  67.91 
 
 
290 aa  364  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2084  aldo/keto reductase  62.59 
 
 
295 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4269  aldo/keto reductase  61.27 
 
 
287 aa  356  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.521186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0329  aldo/keto reductase  60.93 
 
 
280 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3551  aldo/keto reductase  57.24 
 
 
300 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5317  aldo/keto reductase  61.8 
 
 
279 aa  341  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2253  aldo/keto reductase  57.04 
 
 
286 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.84974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2555  aldo/keto reductase  60.58 
 
 
289 aa  323  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1373  aldo/keto reductase  56.23 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2291  aldo/keto reductase  58.06 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.77944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0446  aldo/keto reductase  58.43 
 
 
283 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00031204  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3405  aldo/keto reductase  55.04 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3653  aldo/keto reductase  55.4 
 
 
290 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6541  aldo/keto reductase  54.51 
 
 
288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2292  aldo/keto reductase  53.28 
 
 
293 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7191  aldo/keto reductase  52.98 
 
 
281 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.633848  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1564  aldo/keto reductase  53.36 
 
 
335 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1388  aldo/keto reductase  51.59 
 
 
286 aa  286  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0510  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  46.18 
 
 
292 aa  268  8.999999999999999e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.372806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4547  aldo/keto reductase  53.73 
 
 
278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.877781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0263  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
281 aa  265  5.999999999999999e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00520764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0449  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
300 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1525  aldo/keto reductase  47.94 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.135772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4399  aldo/keto reductase  54.21 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278504  hitchhiker  0.00297654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1321  aldo/keto reductase  47 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0669761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5228  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
281 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5769  putative oxidoreductase  43.77 
 
 
311 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2727  aldo/keto reductase  43.9 
 
 
296 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4576  putative oxidoreductase  43.36 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25594  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1976  putative oxidoreductase  43.01 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1859  putative oxidoreductase  42.65 
 
 
297 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1587  putative oxidoreductase  42.11 
 
 
286 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2239  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
286 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1766  putative oxidoreductase  42.11 
 
 
286 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951362 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1489  putative oxidoreductase  42.11 
 
 
286 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2252  putative oxidoreductase  42.11 
 
 
286 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103537  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3802  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
293 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6338  putative oxidoreductase  42.25 
 
 
291 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2008  putative oxidoreductase  41.4 
 
 
286 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.865157  normal  0.493035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3184  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.07 
 
 
287 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.11057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0010  putative oxidoreductase  43.06 
 
 
300 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.81 
 
 
310 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.418593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6534  putative oxidoreductase  41.7 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.35079 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6037  aldo/keto reductase  40.41 
 
 
293 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3775  putative oxidoreductase  41.13 
 
 
294 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4852  putative oxidoreductase  41.13 
 
 
294 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1340  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
293 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0218  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
293 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2685  aldo/keto reductase  39.73 
 
 
302 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.346212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1935  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
289 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5911  putative oxidoreductase  40.55 
 
 
292 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360934  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1135  aldo/keto reductase  43.2 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2833  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0361368  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6342  putative oxidoreductase  41.44 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0299  putative oxidoreductase  39.25 
 
 
292 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876534  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6751  aldo/keto reductase  42.49 
 
 
275 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2776  putative oxidoreductase  41.58 
 
 
292 aa  198  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2112  putative oxidoreductase  40.86 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6038  putative oxidoreductase  41.55 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.796364 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3561  putative oxidoreductase  38.81 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3959  putative oxidoreductase  38.95 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1329  aldo/keto reductase  42.03 
 
 
291 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398839  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5463  aldo/keto reductase  40.21 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5322  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
285 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5411  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
285 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5701  aldo/keto reductase  41.13 
 
 
285 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2646  putative oxidoreductase  37.5 
 
 
293 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0425  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
309 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3050  putative oxidoreductase  38.25 
 
 
287 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378412  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0889  aldo/keto reductase  40.52 
 
 
268 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0531022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4436  aldo/keto reductase  41.45 
 
 
274 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1273  putative oxidoreductase  38.97 
 
 
292 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.239871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1317  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
290 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329831  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  38.19 
 
 
335 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4700  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
297 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0809909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0942  aldo/keto reductase  37.63 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  37.05 
 
 
390 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4872  aldo/keto reductase  40 
 
 
292 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4961  aldo/keto reductase  40 
 
 
292 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3447  aldo/keto reductase  42.7 
 
 
280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.111465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  37.18 
 
 
401 aa  178  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  38.8 
 
 
328 aa  178  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5796  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
294 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.869077  normal  0.651023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5279  putative oxidoreductase  40.4 
 
 
302 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
327 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  37.83 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3205  aldo/keto reductase  40.27 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0370321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>