More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0762 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2317  GTP-binding protein EngA  79.15 
 
 		 470 aa  749    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318648  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0762  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 467 aa  924    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0334743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2545  GTP-binding protein EngA  64.43 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4625  GTP-binding protein EngA  66.01 
 
 		 447 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2604  GTP-binding protein EngA  66.23 
 
 		 446 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_004310  BR0375  GTP-binding protein EngA  59.88 
 
 		 483 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  58.63 
 
 		 483 aa  580  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0390  GTP-binding protein EngA  59.25 
 
 		 483 aa  578  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.270758  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4413  GTP-binding protein EngA  64.33 
 
 		 446 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4043  GTP-binding protein EngA  64.33 
 
 		 446 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0947633  normal  0.421854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4525  GTP-binding protein EngA  65.21 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  59.74 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  60 
 
 		 459 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3890  GTP-binding protein EngA  63.18 
 
 		 448 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337837  normal  0.0631893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3115  GTP-binding protein EngA  60.51 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  59.57 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  58.41 
 
 		 456 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  59.23 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  58.62 
 
 		 460 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  58.26 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  60.34 
 
 		 470 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  57.89 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2846  GTP-binding protein EngA  59.24 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.64271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0991  GTP-binding protein EngA  58.07 
 
 		 492 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  57.59 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2020  GTP-binding protein EngA  59.14 
 
 		 455 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.866056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  58.3 
 
 		 490 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  57.48 
 
 		 479 aa  538  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0374  GTP-binding protein EngA  55.58 
 
 		 473 aa  537  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2427  GTP-binding protein EngA  56.93 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2498  GTP-binding protein EngA  54.74 
 
 		 602 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2160  GTP-binding protein EngA  56.93 
 
 		 487 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2699  GTP-binding protein EngA  56.72 
 
 		 487 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220146  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1356  GTP-binding protein EngA  56.72 
 
 		 487 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0284939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  53.93 
 
 		 490 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  53.68 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2203  GTP-binding protein EngA  54.23 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3084  GTP-binding protein EngA  50 
 
 		 500 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  53.81 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  51.94 
 
 		 479 aa  465  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0863  GTP-binding protein EngA  51.19 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  42.73 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  42.17 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  42.17 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  42.17 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  42.17 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  41.96 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  39.91 
 
 		 440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.95 
 
 		 464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  39.44 
 
 		 489 aa  336  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  41.15 
 
 		 439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  41.87 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  42.17 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  41.74 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  40.26 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.74 
 
 		 480 aa  333  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 		 439 aa  329  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0504  GTP-binding protein EngA  36.36 
 
 		 442 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.696313  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  41.21 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.72 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  41.54 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  40.48 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  40.56 
 
 		 464 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  41.43 
 
 		 440 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  41.43 
 
 		 447 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1155  GTP-binding protein EngA  41.83 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  38.82 
 
 		 495 aa  323  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  40.56 
 
 		 445 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1063  GTP-binding protein EngA  41.83 
 
 		 447 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  38.26 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  39.78 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  38.26 
 
 		 440 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  38.53 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1416  GTP-binding protein EngA  41.47 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  37.92 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  40.04 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1219  GTP-binding protein EngA  41.83 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0055991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  38.26 
 
 		 441 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  39.41 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  39.54 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0524  GTP-binding protein EngA  36.31 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  39.78 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40.27 
 
 		 439 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  38.91 
 
 		 443 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  39.57 
 
 		 490 aa  315  8e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>