171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0657 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.16 
 
 		 680 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.61 
 
 		 694 aa  722    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.2 
 
 		 718 aa  1039    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.06 
 
 		 688 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.07 
 
 		 706 aa  927    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.29 
 
 		 679 aa  738    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.69 
 
 		 706 aa  955    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.89 
 
 		 710 aa  941    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.46 
 
 		 694 aa  741    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.61 
 
 		 684 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.11 
 
 		 677 aa  746    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.61 
 
 		 702 aa  914    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  56.7 
 
 		 690 aa  721    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.31 
 
 		 707 aa  948    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  65.39 
 
 		 717 aa  805    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.66 
 
 		 689 aa  736    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.08 
 
 		 707 aa  983    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.2 
 
 		 732 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.6 
 
 		 672 aa  638    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.42 
 
 		 706 aa  938    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.89 
 
 		 706 aa  970    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  64.35 
 
 		 704 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.82 
 
 		 712 aa  1100    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.8 
 
 		 697 aa  912    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.69 
 
 		 681 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.69 
 
 		 681 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.64 
 
 		 681 aa  719    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.61 
 
 		 684 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.76 
 
 		 680 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.25 
 
 		 715 aa  959    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2668  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.88 
 
 		 693 aa  681    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0348916  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.92 
 
 		 746 aa  761    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.6 
 
 		 694 aa  746    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.83 
 
 		 692 aa  700    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.36 
 
 		 823 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.29 
 
 		 675 aa  702    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.17 
 
 		 712 aa  1134    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.91 
 
 		 687 aa  714    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.8 
 
 		 710 aa  958    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.11 
 
 		 686 aa  758    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.49 
 
 		 681 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.93 
 
 		 706 aa  945    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 		 711 aa  1392    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.2 
 
 		 775 aa  1037    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.05 
 
 		 700 aa  864    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  82.62 
 
 		 712 aa  1125    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.73 
 
 		 711 aa  1114    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  80.48 
 
 		 718 aa  1050    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  55.43 
 
 		 683 aa  665    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.54 
 
 		 704 aa  949    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4197  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.26 
 
 		 713 aa  900    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.488103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2820  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  55.77 
 
 		 690 aa  675    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000206643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  81.46 
 
 		 712 aa  1125    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.64 
 
 		 680 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.8 
 
 		 710 aa  958    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.14 
 
 		 712 aa  899    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.16 
 
 		 682 aa  657    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.08 
 
 		 842 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3976  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.36 
 
 		 714 aa  901    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.687773  decreased coverage  0.00231033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.49 
 
 		 715 aa  951    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.77 
 
 		 712 aa  701    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.64 
 
 		 712 aa  1119    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.05 
 
 		 671 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.95 
 
 		 671 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.3 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  45.27 
 
 		 890 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.26 
 
 		 669 aa  532  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45 
 
 		 692 aa  528  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0081  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.9 
 
 		 704 aa  527  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.15 
 
 		 718 aa  522  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.93 
 
 		 682 aa  522  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.21 
 
 		 711 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.49 
 
 		 694 aa  525  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.35 
 
 		 744 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.62 
 
 		 672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.35 
 
 		 741 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.04 
 
 		 672 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.24 
 
 		 700 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  43.21 
 
 		 693 aa  512  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.28 
 
 		 768 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6198  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.61 
 
 		 753 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.771465  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.66 
 
 		 674 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.7 
 
 		 653 aa  506  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.02 
 
 		 847 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0692  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.44 
 
 		 708 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000200015  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0766  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  42.9 
 
 		 708 aa  504  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0013002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.27 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_672  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.76 
 
 		 708 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05940  Inorganic H+ pyrophosphatase  43.32 
 
 		 814 aa  500  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.217127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.1 
 
 		 779 aa  501  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.24 
 
 		 779 aa  502  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.27 
 
 		 694 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2413  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.51 
 
 		 698 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.435461  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  44.98 
 
 		 687 aa  494  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0496  Inorganic diphosphatase  44.82 
 
 		 777 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  41.91 
 
 		 679 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.86 
 
 		 652 aa  492  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  41.99 
 
 		 654 aa  492  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.25 
 
 		 674 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  43.39 
 
 		 792 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>