192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0650 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 172 aa  350  8e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 187 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  54.74 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  68.32 
 
 		 227 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  46.52 
 
 		 181 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3022  transcriptional regulator, MerR family  70.41 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.165787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 208 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 195 aa  147  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  65.35 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  76.74 
 
 		 168 aa  143  9e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  61.11 
 
 		 179 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  64.49 
 
 		 179 aa  143  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  74.42 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  74.7 
 
 		 757 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  73.26 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7073  transcriptional regulator, MerR family  72.41 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 282 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  70.73 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 272 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 150 aa  134  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 281 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  65.66 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3031  MerR family transcriptional regulator  68.18 
 
 		 142 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.532106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1669  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3295  transcriptional regulator, MerR family  51.49 
 
 		 231 aa  127  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.987974  normal  0.206317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0267  MerR family transcriptional regulator  69.62 
 
 		 196 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  59.38 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  59.38 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  63.1 
 
 		 245 aa  124  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  58.33 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 840 aa  120  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1782  MerR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 266 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 136 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 130 aa  91.3  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0108  MerR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 124 aa  87  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0163  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 126 aa  87.4  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  59.7 
 
 		 108 aa  85.5  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1864  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0288491  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 118 aa  84  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  48.81 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  50.67 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  50.67 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 118 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  46.91 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  48.68 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  45.12 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  42.55 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  47.62 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  41.49 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 126 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  44.16 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>