More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0648 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  100 
 
 		 146 aa  292  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  65.6 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  53.85 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  54.29 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  54.1 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  51.75 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  60.19 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  58.76 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  49.59 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  55.34 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  55.96 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  52.78 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  51.38 
 
 		 168 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  53.57 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  60.2 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  54.72 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  50.93 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  47.79 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  62.63 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  48.33 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  62.63 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  54.55 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  53.4 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  53.4 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  54.55 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  53.85 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  53.85 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  52.53 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  51.4 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  45.6 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  52.13 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  53.68 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  53.68 
 
 		 106 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  52.04 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  51.04 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  45.71 
 
 		 210 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  45.71 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  50.93 
 
 		 226 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  45.16 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  44.14 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  43.24 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  46.28 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  42.99 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  38.18 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  46.6 
 
 		 130 aa  97.1  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  38.21 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  50 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1117  iojap-related protein  44.23 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  42.16 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  41.58 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  42.42 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  38.46 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  41.05 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  40.54 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  42.42 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  41.94 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  48.48 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  41.94 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  44.44 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  40.74 
 
 		 140 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  41.05 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  41.51 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  38.83 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  39.66 
 
 		 261 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  40.18 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  43.27 
 
 		 256 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  45.45 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  45.45 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  42.7 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  45.45 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  40.74 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  40.4 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  40.62 
 
 		 400 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0798  iojap-like protein  37.74 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.411993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  42.31 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>