More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0629 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0629  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 414 aa  827    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00302597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  46.59 
 
 		 387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.57 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.24 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.95 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  42.94 
 
 		 389 aa  266  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  42.37 
 
 		 435 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.69 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2581  hypothetical protein  40.52 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2435  hypothetical protein  40.23 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4789  RND family efflux transporter MFP subunit  42.27 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1665  secretion protein HlyD  41.59 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.454837  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  40.23 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3304  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.43 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  40.86 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  37.43 
 
 		 406 aa  225  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  40.41 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.94 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  37.94 
 
 		 371 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0869  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  38.26 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  35.26 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  35.24 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.04 
 
 		 392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.5 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.28 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  35.13 
 
 		 368 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  36.75 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 		 385 aa  196  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.08 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3814  RND family efflux transporter MFP subunit  37.65 
 
 		 414 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.14573  normal  0.243008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  32.65 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.46 
 
 		 396 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  37.68 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  35.61 
 
 		 409 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 393 aa  192  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  34.69 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  37.64 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  36.51 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  36.51 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  36.51 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 		 377 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  34.3 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  37.68 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.96 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  36.93 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  34.27 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  34.5 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.92 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  37.07 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  32.35 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  36.02 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  35.98 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  34.92 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.07 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  34.67 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  36.78 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.28 
 
 		 388 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  31.11 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.19 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  32.4 
 
 		 413 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  34.17 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  32.49 
 
 		 414 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.85 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  35.18 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  34.73 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  35 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  30.46 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  34.73 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  36.36 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  33.33 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  33.6 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 395 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  33.33 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>