More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0604 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  100 
 
 		 368 aa  747    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  67.55 
 
 		 389 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  54.99 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  54.84 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  53.51 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  54.74 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  56 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  54.91 
 
 		 382 aa  363  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  53.98 
 
 		 389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  53.97 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  54.3 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  55.69 
 
 		 379 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  55.1 
 
 		 379 aa  347  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  53.35 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  55.41 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  48.86 
 
 		 394 aa  322  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  47.06 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  46.9 
 
 		 407 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  42.41 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  44.44 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.59 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  41.99 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  43.05 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  42.27 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  41.97 
 
 		 394 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.67 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  42.78 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  39.89 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  46.84 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  40.97 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  38.7 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  40.99 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  44.9 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  39.51 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  37.75 
 
 		 355 aa  238  9e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  42.86 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  44.85 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  40.96 
 
 		 388 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  43.6 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  39.66 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  43.45 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  36.77 
 
 		 413 aa  229  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  43.39 
 
 		 378 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  42.23 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  40.54 
 
 		 383 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  37.25 
 
 		 395 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  38.91 
 
 		 503 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  40.91 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  38.75 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  38.26 
 
 		 498 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  42.21 
 
 		 464 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  38.16 
 
 		 477 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  38.24 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  38.79 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  41.81 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.14 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  40.26 
 
 		 447 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  37.5 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  40.77 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  42.76 
 
 		 447 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  41.08 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  41.08 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  41.21 
 
 		 471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  37.87 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  39.67 
 
 		 333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  33.98 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  38.58 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  40.38 
 
 		 452 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  39.25 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  40.85 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  40.85 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  40.6 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  36.78 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  39.6 
 
 		 457 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  39.74 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  40.47 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  39.94 
 
 		 474 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  37.67 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  40.26 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.88 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.45 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  38.23 
 
 		 308 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  41.89 
 
 		 406 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  38.23 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  40.86 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.56 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  36.16 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  34.12 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  37.37 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  33.98 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  38.78 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  33.43 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  33.43 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  34.44 
 
 		 386 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  33.69 
 
 		 386 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  36.21 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  38.51 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  32.38 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  38.24 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2798  HflK protein  35.67 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.786571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>