More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0536 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 469 aa  945    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  69.84 
 
 		 466 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  63.43 
 
 		 471 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  63.64 
 
 		 474 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  63.21 
 
 		 471 aa  521  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  61.49 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  62.08 
 
 		 474 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  63.21 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  63.21 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  62.31 
 
 		 457 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  60.64 
 
 		 444 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  61.19 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  60.32 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  60 
 
 		 455 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  59.06 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  60.56 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  58.43 
 
 		 442 aa  471  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  58.88 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  59.33 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  58.2 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  56.63 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  56.42 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  59.75 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  55.76 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  55.53 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  54.48 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  56.34 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  57.32 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  53.69 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  51.65 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  53.58 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  57.39 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  57.37 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  54.48 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  50.48 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  51.88 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  54.41 
 
 		 432 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  53.98 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  55.32 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  55.32 
 
 		 447 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  56.98 
 
 		 448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  51.54 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  48.83 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  48.27 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  50.55 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  47.79 
 
 		 414 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  47.51 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  51.88 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.68 
 
 		 421 aa  302  7.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  51.88 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  51.88 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  48.23 
 
 		 441 aa  302  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  45.77 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  47.95 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.88 
 
 		 489 aa  297  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  49.17 
 
 		 445 aa  297  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.77 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.6 
 
 		 489 aa  296  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  44.91 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  49.44 
 
 		 461 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  49.56 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.13 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  47.38 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  46.58 
 
 		 426 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  45.52 
 
 		 432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  45.52 
 
 		 432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.72 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  45.65 
 
 		 481 aa  289  7e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  48.55 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  46.58 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  46.58 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  50.64 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  48.22 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  53.07 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  53.07 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  45.6 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  52.73 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  46.3 
 
 		 428 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  44.62 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  49.03 
 
 		 454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  49.11 
 
 		 429 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 		 442 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  45.6 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  45.6 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  42.64 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  46.2 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  45.6 
 
 		 426 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  51.77 
 
 		 392 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  52.09 
 
 		 396 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>