More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0517 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  100 
 
 		 419 aa  820    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  50.25 
 
 		 414 aa  334  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  45.69 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  44.56 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  42.89 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  43 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  41.62 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  41.31 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  44.84 
 
 		 404 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  45.86 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  45.09 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  42.52 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  38.71 
 
 		 426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  37.62 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  42.49 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  41.75 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  42.49 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  36.8 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  40.58 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  32.91 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  31.49 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  38.06 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  30.61 
 
 		 441 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  30.23 
 
 		 441 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  30.84 
 
 		 441 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  34.5 
 
 		 440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  30.84 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  29.41 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  30.84 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  29.47 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  30.61 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  31.4 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  31.4 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  31.4 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  31.4 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.3 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  30.22 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  31.48 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  30.65 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  31.25 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  31.98 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  30.42 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  30.73 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.71 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  31.25 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  30.54 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  30.03 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  32.41 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  32.41 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  31.25 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  31.87 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  31.87 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  32.18 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.5 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.7 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  30.56 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  30.87 
 
 		 423 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  29.95 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  29.95 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  32.09 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  29.12 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  29.64 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  29.23 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  31.16 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  29.77 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.65 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  28.64 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.73 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  29.97 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.76 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  27.39 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  26.28 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  27.39 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  29.56 
 
 		 577 aa  126  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  29.98 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  26.6 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  31.47 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.23 
 
 		 414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  29.62 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  27.53 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.95 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  26.38 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  26.98 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  29.77 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  28.12 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  27.66 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  30.08 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  32.45 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  27.82 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  27.37 
 
 		 410 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.07 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  26.99 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.1 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  28.61 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  26.54 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  28.21 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  27.75 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  28.04 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25.78 
 
 		 424 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  29.64 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>