76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0481 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  58.05 
 
 		 177 aa  204  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  56.21 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  56.77 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  56.13 
 
 		 176 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  53.37 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  52.9 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  55.7 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  47.46 
 
 		 175 aa  151  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  47.83 
 
 		 187 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  48.77 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  50.62 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  46.75 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  46.51 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  45.98 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  42.59 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  41.86 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  44.94 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  45.86 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  43.67 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  44.65 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  44.03 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  42.07 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  45.18 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  40.65 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  36.71 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  37.75 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  34.66 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  34.09 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  37.11 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  36.31 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  35.46 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  38.73 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  32.35 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  44.04 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  35.67 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  35.92 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  29.76 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  40.59 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  31.29 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  30.5 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  30.5 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  35.96 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  28.37 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  29.93 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  29.93 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  27.66 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  27.66 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000036824  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  30.56 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  26.95 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  30.3 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  31.9 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  26.76 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  29.53 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  28 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13093  hypothetical protein  27.22 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.545898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  30.58 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  30.61 
 
 		 138 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  30.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  31.48 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>