36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0406 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  863    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  58.99 
 
 		 459 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  62.2 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  61.56 
 
 		 432 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  57.11 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  53.75 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  52.42 
 
 		 555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  52.39 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  50.37 
 
 		 460 aa  425  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  54.32 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  46.68 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  46.21 
 
 		 733 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  32.37 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  35.04 
 
 		 929 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  30.87 
 
 		 503 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  29.27 
 
 		 534 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  31.26 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  31.12 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  29.73 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  31.59 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  31.52 
 
 		 466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  31.49 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  32.13 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  27.99 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  27.78 
 
 		 560 aa  170  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  30.2 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  29.66 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  30.21 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  26.44 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  29.09 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.07 
 
 		 1967 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  29.22 
 
 		 437 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  27.18 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  43.24 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  31.96 
 
 		 541 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  26.24 
 
 		 754 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>