More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0387 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 402 aa  823    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  53.03 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  44.84 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  42.46 
 
 		 402 aa  303  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  42.61 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  42.57 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  41.9 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  44.06 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  38.16 
 
 		 424 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  41.04 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.19 
 
 		 403 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  38.16 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  42.7 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  38.46 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  41.23 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  41.55 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  39.52 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  39.75 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  39.31 
 
 		 377 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  39.5 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  39.5 
 
 		 400 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  39.45 
 
 		 402 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  39.57 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  35.77 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.96 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  35.61 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  34.34 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  36.47 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.62 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  35.77 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  34.97 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  37.22 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  34.84 
 
 		 467 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  32.52 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  35.11 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  35.43 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  34.62 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.95 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  35.25 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  33.24 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  38.17 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  33.17 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  34.49 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  32.89 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  32.16 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  30.83 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  31.64 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  35.19 
 
 		 393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  32.95 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  30.29 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.54 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  29.66 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 		 413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  31.09 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  29.82 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  27.39 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  27.15 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  27.46 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.39 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.77 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.13 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  29.17 
 
 		 371 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  26.48 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  27.38 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  26.84 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.16 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  29.97 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  30.25 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.97 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.71 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  29.33 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  29.33 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.43 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  25.63 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  30.08 
 
 		 404 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.63 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  29.13 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.86 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.89 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  29.26 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  26.46 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  25.3 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  25.18 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  28.01 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.17 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  24.36 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  26.5 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  24.7 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.06 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  27.03 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.23 
 
 		 376 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  27.56 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  27.08 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  26.86 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  26.2 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  25.13 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  26.99 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  28.01 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>