110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0376 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  100 
 
 
249 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  86.06 
 
 
260 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  78.1 
 
 
245 aa  394  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  71.56 
 
 
230 aa  346  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  67.4 
 
 
230 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  67.56 
 
 
231 aa  324  8e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  43.66 
 
 
296 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  41.42 
 
 
292 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  41.42 
 
 
292 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  41.42 
 
 
292 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  41.42 
 
 
292 aa  182  5e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  41.42 
 
 
292 aa  181  8e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  46.15 
 
 
421 aa  179  3e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  42.63 
 
 
294 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  42.53 
 
 
290 aa  174  1e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98818e-07 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  44.31 
 
 
277 aa  174  1e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  40.84 
 
 
303 aa  172  4e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  39.27 
 
 
291 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  38.29 
 
 
290 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  42.74 
 
 
276 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  38.52 
 
 
291 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  37.97 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  36.77 
 
 
324 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  37.31 
 
 
326 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  39.08 
 
 
310 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  38.84 
 
 
300 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  36.67 
 
 
293 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  38.31 
 
 
298 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  38.31 
 
 
314 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  38.31 
 
 
298 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  38.96 
 
 
308 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  39.39 
 
 
304 aa  140  2e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  39.39 
 
 
304 aa  140  2e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  39.39 
 
 
301 aa  139  4e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  38.96 
 
 
301 aa  139  5e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  38.73 
 
 
205 aa  132  8e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  35.59 
 
 
224 aa  130  2e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  35.37 
 
 
228 aa  129  5e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  34.36 
 
 
231 aa  125  4e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.26374e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  33.04 
 
 
227 aa  125  8e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  38.42 
 
 
188 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  38.42 
 
 
188 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  38.2 
 
 
189 aa  119  4e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  36.02 
 
 
190 aa  117  2e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  37.31 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.98472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  37.31 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  37.31 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  37.31 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.03709e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  38.17 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  37.31 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.13334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  37.31 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  37.31 
 
 
189 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.89969e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  31.78 
 
 
301 aa  116  4e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  38.17 
 
 
189 aa  115  7e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.60321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  37.63 
 
 
189 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  33.33 
 
 
203 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  37.23 
 
 
189 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  36.7 
 
 
189 aa  112  7e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  30.22 
 
 
302 aa  111  1e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  34.44 
 
 
190 aa  110  2e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  35.23 
 
 
189 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.21736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  28.77 
 
 
284 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  33.16 
 
 
200 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  31.4 
 
 
270 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  28.52 
 
 
316 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  31.15 
 
 
190 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  29.18 
 
 
303 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  32.4 
 
 
289 aa  95.5  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  32.18 
 
 
308 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  32.8 
 
 
193 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.16085e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  32.32 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  27.52 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  29.9 
 
 
321 aa  92.8  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  31.28 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  26.74 
 
 
290 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  30.41 
 
 
297 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  28.57 
 
 
284 aa  88.6  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  28.57 
 
 
287 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  28.57 
 
 
308 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  29.69 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  28.06 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  28.06 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  28.57 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  30.06 
 
 
184 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  30.14 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  29.5 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  26.96 
 
 
285 aa  84.7  1e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  27.07 
 
 
292 aa  84.7  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  29.38 
 
 
274 aa  84.3  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  26.96 
 
 
285 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  26.96 
 
 
285 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  26.09 
 
 
285 aa  78.6  8e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  30.22 
 
 
297 aa  75.1  9e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  29.41 
 
 
298 aa  73.6  3e-12  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  1.23231e-11 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  27.19 
 
 
307 aa  68.2  1e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  27.19 
 
 
307 aa  67.8  2e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  27.88 
 
 
307 aa  67  3e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  27.08 
 
 
304 aa  66.6  3e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  27.81 
 
 
294 aa  66.6  3e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  28.89 
 
 
298 aa  65.9  6e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>