More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0373 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
332 aa  666    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  70.57 
 
 
331 aa  461  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  60.98 
 
 
339 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  61.97 
 
 
339 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  50.65 
 
 
335 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  48.06 
 
 
350 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  47.77 
 
 
330 aa  321  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  47.77 
 
 
330 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  51.16 
 
 
338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  49.5 
 
 
319 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  47.34 
 
 
334 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  49.5 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  49.83 
 
 
340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  46.91 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  49.5 
 
 
340 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  45.93 
 
 
324 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  48.51 
 
 
360 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.6 
 
 
324 aa  295  8e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  45.54 
 
 
341 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  44.09 
 
 
319 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  44.37 
 
 
319 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  46.08 
 
 
311 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  46.08 
 
 
311 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  46.18 
 
 
347 aa  290  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  46.86 
 
 
353 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  44.48 
 
 
337 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  49.17 
 
 
337 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  48.68 
 
 
342 aa  288  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 
383 aa  288  9e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 
327 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.2 
 
 
353 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.2 
 
 
353 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.2 
 
 
353 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  44.63 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  42.35 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  43.87 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  44.55 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  45.45 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  45.87 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  44.63 
 
 
366 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
358 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 
359 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  45.1 
 
 
348 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  45.39 
 
 
335 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  45.63 
 
 
339 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  46.86 
 
 
347 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  48.39 
 
 
373 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  48.39 
 
 
373 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  46.86 
 
 
347 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  46.86 
 
 
347 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  47.76 
 
 
334 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 
312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  48.22 
 
 
336 aa  273  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  46.53 
 
 
348 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  42.54 
 
 
320 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  42.54 
 
 
334 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  46.2 
 
 
347 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  43.67 
 
 
346 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  46.2 
 
 
347 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 
383 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  41.72 
 
 
312 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  45.65 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0192  putative glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
310 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  42.3 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0162  putative glycosyl transferase family protein  44.66 
 
 
316 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  40.73 
 
 
312 aa  263  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 
339 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  41.53 
 
 
343 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 
310 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  42.3 
 
 
339 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  41.35 
 
 
306 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  41.48 
 
 
308 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  38.22 
 
 
321 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  42.05 
 
 
312 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  41.8 
 
 
310 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  41.48 
 
 
308 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  41.48 
 
 
308 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  41.48 
 
 
310 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0804  glycosyl transferase family protein  41.42 
 
 
312 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5572  glycosyl transferase family 2  44.48 
 
 
340 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 
327 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 
333 aa  255  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.11 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  38.11 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  39.94 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  38.11 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.11 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  39.35 
 
 
336 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 
345 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 
341 aa  252  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 
324 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  40.97 
 
 
306 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.97 
 
 
319 aa  250  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25741  glycosyl transferase family protein  43.87 
 
 
324 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.18 
 
 
308 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>