More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0372 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 519 aa  1014    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  64.83 
 
 		 509 aa  586  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  56.5 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  56.5 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  55.71 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  57.09 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  57.31 
 
 		 509 aa  422  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  59.38 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  50.4 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  50.3 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  50.6 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  50.1 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  48.51 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  51 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  53.81 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  40.66 
 
 		 529 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  40.46 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  40.46 
 
 		 555 aa  303  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  44.06 
 
 		 512 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  43.92 
 
 		 535 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  43.68 
 
 		 522 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  46.63 
 
 		 510 aa  293  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  42.64 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  41.38 
 
 		 514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  40.54 
 
 		 520 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  40.78 
 
 		 526 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  42.63 
 
 		 513 aa  272  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  39.73 
 
 		 525 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  40.13 
 
 		 528 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  38.69 
 
 		 529 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  41.04 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  39.2 
 
 		 517 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  39.2 
 
 		 517 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  42.31 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  41.83 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  41.83 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 495 aa  257  4e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  39.71 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  35.36 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  36.93 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  36.12 
 
 		 522 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 		 521 aa  246  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  37.14 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  35.96 
 
 		 511 aa  238  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  34.71 
 
 		 516 aa  236  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  34.27 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  40.05 
 
 		 514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  34.25 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  35.57 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.93 
 
 		 495 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  35.29 
 
 		 521 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  35.17 
 
 		 511 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  33.87 
 
 		 511 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  33.79 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  34.72 
 
 		 511 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  35.19 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  35.19 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  35.19 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 516 aa  226  7e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  35.19 
 
 		 511 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  39.9 
 
 		 543 aa  226  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  34.95 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  34.32 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  34.95 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  34.95 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  34.95 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  34.95 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.37 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.56 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 527 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  32.69 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 508 aa  224  4e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  33.02 
 
 		 522 aa  223  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  35.2 
 
 		 518 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  34.4 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  34.71 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  34.1 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 		 514 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  33.68 
 
 		 505 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  35.24 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  32.21 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  32.25 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.33 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 		 511 aa  217  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  37.27 
 
 		 525 aa  217  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 542 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  41.16 
 
 		 534 aa  216  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  34.32 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 518 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  33.92 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>