More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0321 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0321  response regulator receiver protein  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0435098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3325  two component Fis family transcriptional regulator  88 
 
 		 199 aa  323  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0552341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0571  two component transcriptional regulator, Fis family  78.45 
 
 		 200 aa  291  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4363  two component Fis family transcriptional regulator  77.05 
 
 		 199 aa  289  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0607  response regulator receiver protein  77.35 
 
 		 200 aa  288  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307658  normal  0.154969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1834  response regulator receiver protein  76.92 
 
 		 199 aa  288  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0596  response regulator receiver  77.35 
 
 		 209 aa  288  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.186654  normal  0.0367411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4890  two component Fis family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 198 aa  288  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993283  decreased coverage  0.000990624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7660  two-component transcriptional regulator RegR  75.14 
 
 		 224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4041  response regulator receiver protein  72.34 
 
 		 188 aa  277  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.631958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0360  response regulator receiver domain-containing protein  71.91 
 
 		 195 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0692819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0231  response regulator receiver domain-containing protein  73.99 
 
 		 184 aa  277  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0131  response regulator receiver  73.41 
 
 		 184 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0059  two component Fis family transcriptional regulator  73.41 
 
 		 184 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0111  helix-turn-helix, Fis-type  73.41 
 
 		 184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0286945 
 
 
-
 
NC_004310  BR0137  DNA-binding response regulator  70.33 
 
 		 187 aa  269  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0131  DNA-binding response regulator  70.33 
 
 		 187 aa  269  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00417692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0574  two component transcriptional regulator, Fis family  71.68 
 
 		 184 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0306  two component Fis family transcriptional regulator  73.71 
 
 		 184 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.0618542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3989  two component transcriptional regulator, Fis family  72.57 
 
 		 192 aa  264  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4317  response regulator receiver protein  72.57 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0275462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0018  two component Fis family transcriptional regulator  70.88 
 
 		 208 aa  263  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.594546  normal  0.0172011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0063  two component response regulator  69.14 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0150  two component Fis family transcriptional regulator  69.78 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0170  two component Fis family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 184 aa  253  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.485216  normal  0.727058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3273  two component Fis family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 194 aa  253  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1518  PrrA (RegA), response regulator involved in oxygen regulation of photosynthesis genes  70.45 
 
 		 184 aa  253  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2959  two component Fis family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 184 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0531334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2838  response regulator receiver protein  68.57 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3430  photosynthetic apparatus regulatory protein RegA  69.14 
 
 		 184 aa  243  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4068  response regulator receiver domain-containing protein  70.29 
 
 		 186 aa  237  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2863  response regulator receiver protein  69.36 
 
 		 183 aa  224  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.274162  normal  0.59867 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4650  two component Fis family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 185 aa  218  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2781  two component Fis family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 182 aa  215  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4553  DNA-binding response regulator  48.94 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.023221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4230  helix-turn-helix, Fis-type  48.4 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2202  response regulator receiver domain-containing protein  48.3 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12560  Response regulator RegA/PrrA/ActR type  49.44 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2205  two component Fis family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0007  two component Fis family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1607  two component Fis family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.016434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2255  two component transcriptional regulator, Fis family  48.24 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2343  two component transcriptional regulator, Fis family  48.24 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0927  two component Fis family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0931  two component Fis family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0888  two component transcriptional regulator, Fis family  50.88 
 
 		 186 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2690  two component Fis family transcriptional regulator  49.71 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5107  putative two-component response regulator  49.45 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58300  putative two-component response regulator  49.45 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0163  response regulator  47.46 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4290  two component Fis family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3252  response regulator  47.46 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.10506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0384  response regulator protein  47.46 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.396029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2175  Fis family DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2914  Fis family DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.600454  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3434  Fis family DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.810628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0189  Fis family DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0199  Fis family DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0821  two component Fis family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0848  two component Fis family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0068  two component Fis family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3089  two component Fis family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0341  two component transcriptional regulator, Fis family  45.98 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3110  two component Fis family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6444  two component Fis family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2479  response regulator receiver protein  46.93 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000248912  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3093  response regulator receiver protein  46.93 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0804017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3002  two component Fis family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0135  response regulator receiver domain-containing protein  45.86 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0404616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3140  response regulator receiver protein  46.93 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4382  two component Fis family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0040  response regulator transcription regulator protein  45.45 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3895  two component Fis family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5543  two component transcriptional regulator, Fis family  44.25 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1522  two component transcriptional regulator, Fis family  45.03 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2976  DNA binding response regulator  43.45 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1502  response regulator receiver protein  44.89 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233016  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1419  two component Fis family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.104403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3388  two component transcriptional regulator, Fis family  44.92 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3711  two component transcriptional regulator, Fis family  44.92 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4069  two component Fis family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 200 aa  137  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1826  response regulator receiver domain-containing protein  48.04 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00235342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0553  two component Fis family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4063  two component Fis family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309785  normal  0.299316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1585  helix-turn-helix, Fis-type  46.78 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0640788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4819  DNA-binding response regulator  41.76 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.982858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0666  two component transcriptional regulator, Fis family  48.52 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0590  two component Fis family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1641  response regulator receiver protein  45.03 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.772734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3342  two component Fis family transcriptional regulator  44 
 
 		 178 aa  134  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2271  two component transcriptional regulator, Fis family  44.77 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2781  two component Fis family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3186  response regulator receiver protein  43.53 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2036  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regA  42.69 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0172  helix-turn-helix, Fis-type  43.65 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00427429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1844  response regulator receiver protein  41.62 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0730516  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0438  two component Fis family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0464  two component transcriptional regulator, Fis family  40.46 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3529  response regulator receiver protein  40.23 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3707  response regulator receiver protein  40.23 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>