More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0295 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  100 
 
 
345 aa  702  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  80.67 
 
 
343 aa  546  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  80.31 
 
 
327 aa  534  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  79.31 
 
 
327 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  76.56 
 
 
324 aa  514  1e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.28 
 
 
338 aa  492  1e-138  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7188  quinolinate synthetase  74.21 
 
 
323 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.014878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  73.44 
 
 
323 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6033  quinolinate synthetase  73.27 
 
 
323 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.452115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.57 
 
 
357 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.35 
 
 
357 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  74.84 
 
 
307 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  70.25 
 
 
347 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  68.55 
 
 
333 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  71.92 
 
 
333 aa  470  1e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0429  quinolinate synthetase  69.81 
 
 
323 aa  466  1e-130  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1183  quinolinate synthetase complex, A subunit  72.29 
 
 
347 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244907  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  71.81 
 
 
323 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1429  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.06 
 
 
328 aa  447  1e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  69.46 
 
 
358 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1045  quinolinate synthetase  70.81 
 
 
323 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.350076  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  65.71 
 
 
369 aa  414  1e-115  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  61.28 
 
 
359 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23170  quinolinate synthetase A  62.03 
 
 
375 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  61.77 
 
 
370 aa  404  1e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  61.73 
 
 
370 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  61.73 
 
 
370 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  62.86 
 
 
370 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4308  quinolinate synthetase  61.4 
 
 
365 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  61.86 
 
 
343 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1541  quinolinate synthetase complex, A subunit  64.84 
 
 
326 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.258054  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  55.03 
 
 
350 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2250  quinolinate synthetase  54.14 
 
 
351 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.340783  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0438  quinolinate synthetase  52.69 
 
 
343 aa  338  6e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1004  quinolinate synthetase  52.4 
 
 
343 aa  337  2e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.529282  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0785  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.93 
 
 
347 aa  259  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  47.62 
 
 
305 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  48.46 
 
 
302 aa  258  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  47.12 
 
 
304 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.27 
 
 
303 aa  254  1e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  48.46 
 
 
302 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.28992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.44 
 
 
301 aa  253  4e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.71 
 
 
298 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  46.94 
 
 
302 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.05 
 
 
306 aa  246  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  42.18 
 
 
304 aa  246  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
304 aa  244  1e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  45.42 
 
 
303 aa  244  1e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.62 
 
 
304 aa  244  2e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  44.04 
 
 
304 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.96344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  44.37 
 
 
304 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  44.03 
 
 
304 aa  242  8e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.25089e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  42.62 
 
 
325 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  45.58 
 
 
304 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  42.62 
 
 
325 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0419  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.66 
 
 
344 aa  239  7e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.748276  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  42.37 
 
 
307 aa  239  7e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  45.58 
 
 
304 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.76339e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.44 
 
 
295 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.39 
 
 
332 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  42.19 
 
 
333 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.57 
 
 
317 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.16 
 
 
323 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.30693e-06  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  43.24 
 
 
304 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  40.07 
 
 
323 aa  235  1e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
310 aa  234  2e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.09 
 
 
302 aa  233  4e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.3 
 
 
307 aa  233  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  45.15 
 
 
331 aa  233  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  41.95 
 
 
323 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  43.1 
 
 
306 aa  232  9e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.16 
 
 
308 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  43.33 
 
 
322 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  42.71 
 
 
306 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.08382e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  45.22 
 
 
334 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.46 
 
 
334 aa  229  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.03 
 
 
324 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  39.38 
 
 
304 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  44.9 
 
 
334 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.12 
 
 
303 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.2 
 
 
338 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.38 
 
 
330 aa  225  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  39.04 
 
 
304 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  46.52 
 
 
347 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  39.45 
 
 
304 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  40.88 
 
 
322 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.06 
 
 
304 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  41.28 
 
 
324 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  39.53 
 
 
312 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  45.22 
 
 
326 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  42.94 
 
 
334 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.34 
 
 
298 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  43.09 
 
 
310 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  40 
 
 
328 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  39.1 
 
 
304 aa  223  5e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  40.4 
 
 
306 aa  221  2e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  39.67 
 
 
328 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.6 
 
 
322 aa  219  4e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.98 
 
 
346 aa  219  8e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  43.48 
 
 
337 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>