224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0244 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
315 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  56.82 
 
 
320 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  57.93 
 
 
310 aa  358  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  55.66 
 
 
310 aa  345  5e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  55.66 
 
 
310 aa  345  8e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  43.26 
 
 
315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  45.68 
 
 
321 aa  235  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  45.68 
 
 
315 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  42.76 
 
 
349 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  45.39 
 
 
308 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  40.92 
 
 
314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  39.88 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  37.3 
 
 
352 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  39.36 
 
 
346 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  35.23 
 
 
347 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  33.78 
 
 
364 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  33.44 
 
 
364 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  35.52 
 
 
351 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
322 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  29.3 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.19 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  31.65 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  32.2 
 
 
298 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  35.62 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 
313 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 
299 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 
307 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
342 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
309 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
321 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 
342 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  28.45 
 
 
312 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  28.81 
 
 
351 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 
310 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  30.99 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 
302 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.05 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.3 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  28.32 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
597 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  30.98 
 
 
325 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  34.26 
 
 
312 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.43 
 
 
318 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  33.08 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.32 
 
 
438 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
316 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  28.93 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  24.48 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  25.67 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.46 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.41 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  31.31 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.04 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.04 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  29.19 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  28.92 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.37 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  22.73 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2853  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.52 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  22.48 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  27.94 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  27.94 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  27 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  28.17 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  24.55 
 
 
332 aa  72.4  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  27.31 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  25.41 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  27.65 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  26.69 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  25.4 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25.38 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.83 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  25.24 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.09 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  27.52 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  26.6 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>