73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0157 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  63.38 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  34.55 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  35.96 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  35.43 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  35.06 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  34.27 
 
 		 246 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  35.23 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  33.69 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  31.55 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  32.82 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  36.24 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  34.08 
 
 		 225 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  36.84 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  31.02 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  34.48 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  40.19 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  33.7 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  33.7 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.72 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  32.05 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  32.67 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  29.33 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  25.15 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  32.21 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.06 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  29.8 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  30.12 
 
 		 275 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  27.54 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  30.15 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  27.67 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.71 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  26.09 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  27.41 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  27.59 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  27.86 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  25.33 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  28.12 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  25.33 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  30.23 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  26.62 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  25.18 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  28.99 
 
 		 323 aa  54.7  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  31.51 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  29.65 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.51 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  28.75 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  29.03 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  26.98 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  28.89 
 
 		 181 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  24.82 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  31.16 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  25.47 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.36 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  24.71 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  22.06 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  24.57 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  22.5 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  29.17 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  27.61 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  25 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  29.17 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  25.38 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  28.29 
 
 		 181 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1660  OstA-like protein  25.98 
 
 		 760 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173094  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>