More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0108 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  833    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  66.5 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  67.9 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  64.41 
 
 		 437 aa  531  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  64.55 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  66.17 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  64.55 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  67.75 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  64.3 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  68.42 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  64.16 
 
 		 437 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  66.17 
 
 		 439 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  66 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  66 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  66.18 
 
 		 441 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  61.39 
 
 		 437 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  63.59 
 
 		 437 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  62.84 
 
 		 437 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  65.43 
 
 		 441 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  60.1 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  68.07 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  60.49 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  58.56 
 
 		 447 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  58.48 
 
 		 443 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  57.25 
 
 		 444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  53.71 
 
 		 431 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  56.22 
 
 		 438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  56.37 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  56.37 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  57.39 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  53.22 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  53.22 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  52.42 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  52.42 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  53.79 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  55.74 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  55.74 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  55.33 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  54.34 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  58.21 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  54.94 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  57.88 
 
 		 428 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  52.57 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  54.09 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  54.59 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  53.19 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  44.94 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 421 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  37.98 
 
 		 438 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.47 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  30.81 
 
 		 402 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  30.81 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  30.81 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  31.06 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  30.81 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  30.56 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  30.56 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  30.56 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  31.37 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  30.58 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  30.1 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  30.1 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  30.1 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  30.1 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  30.1 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.02 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  29.02 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 408 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 405 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 436 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 416 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  27.23 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>