279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0099 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
250 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  51.05 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  44.35 
 
 
239 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  43.62 
 
 
247 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  39.92 
 
 
276 aa  168  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  43.62 
 
 
247 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  43.39 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  40.4 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  45.1 
 
 
259 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  41.43 
 
 
252 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  40.59 
 
 
251 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  41.43 
 
 
252 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  41.43 
 
 
252 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  41.43 
 
 
252 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  41.43 
 
 
252 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  39.58 
 
 
252 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  39.58 
 
 
252 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  36.72 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  41.06 
 
 
247 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  39.33 
 
 
251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  40.96 
 
 
248 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  36.33 
 
 
256 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  41.91 
 
 
264 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  48.79 
 
 
245 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  49.19 
 
 
245 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  35.89 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  37.3 
 
 
271 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  42.46 
 
 
254 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  38.49 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  41.8 
 
 
252 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  46.34 
 
 
245 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  47.15 
 
 
245 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  47.15 
 
 
245 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  38.59 
 
 
248 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  46.75 
 
 
245 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  42.5 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  44.76 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  46.31 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  46.31 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  37.75 
 
 
249 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  42.74 
 
 
258 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  42.74 
 
 
258 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  44.17 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  38.96 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  47.97 
 
 
245 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  40.39 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  35.25 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  37.15 
 
 
265 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2785  protein of unknown function DUF81  45.11 
 
 
255 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  32.93 
 
 
251 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2380  protein of unknown function DUF81  44.68 
 
 
255 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  33.19 
 
 
253 aa  121  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  32.67 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  35.92 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  35.48 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  32.82 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  39.15 
 
 
249 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  39.76 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  44.8 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  43.43 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  40.16 
 
 
249 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2517  hypothetical protein  47.21 
 
 
255 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11302  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  40.42 
 
 
259 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  42.55 
 
 
253 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  32.03 
 
 
260 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  39.72 
 
 
258 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  27.57 
 
 
252 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  31.71 
 
 
252 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  28.74 
 
 
262 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  34.63 
 
 
254 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
256 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  40.32 
 
 
256 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 
251 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  30.93 
 
 
249 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  31.62 
 
 
269 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  29.72 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  29.72 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  29.72 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  28.3 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  27.31 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 
253 aa  88.6  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  28.93 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  29.2 
 
 
292 aa  87  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  36.21 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  31.78 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  27.2 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  29.92 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  32.06 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  28.08 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  28.4 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  29.41 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  27.98 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.03 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  29.66 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  31.82 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  29.66 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  27.38 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>