More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0091 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 306 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3039  secretion protein HlyD  44.98 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0549  hypothetical protein  43.89 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0918  RND family efflux transporter MFP subunit  41.79 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3030  secretion protein HlyD  41.01 
 
 		 306 aa  178  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0446257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3605  secretion protein HlyD  42.91 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1328  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.23 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4685  secretion protein HlyD  42.76 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3611  secretion protein HlyD  42.69 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.711693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.04 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0556  HlyD family secretion protein  41.39 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1002  secretion protein HlyD  41.32 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.677003  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0890  secretion protein HlyD  39.58 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.459513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1007  secretion protein HlyD  38.3 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163323  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0908  HlyD family secretion protein  37.14 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5160  secretion protein HlyD  38.79 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1337  HlyD family secretion protein  40.16 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.33 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  37.8 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0895  secretion protein HlyD  36.61 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  43.85 
 
 		 427 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  43.32 
 
 		 402 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  41.27 
 
 		 385 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.78 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.01 
 
 		 414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  41.8 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.79 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.79 
 
 		 396 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.11 
 
 		 413 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  39.57 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  41.27 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.25 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  41.27 
 
 		 386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.14 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.57 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  35.91 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  34.46 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  37.91 
 
 		 426 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  36.63 
 
 		 393 aa  99.4  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  35.36 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  36.22 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  36.22 
 
 		 389 aa  92.4  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  35.44 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  35.68 
 
 		 404 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.44 
 
 		 390 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  28.95 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  33.96 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  31.09 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  31.09 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.94 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  32.1 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 609 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  29.59 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.33 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  29.53 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  32.73 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.53 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  31.02 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  31.38 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  33.12 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 486 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  31.29 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  30.16 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  30.41 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  31.05 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.16 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 		 473 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  27.51 
 
 		 550 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  27.86 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  31.22 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  29.96 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.46 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.46 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  31.29 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.97 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0121  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000605752  hitchhiker  0.000000000000341036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 517 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.75 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  29.35 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>