117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0088 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  58.78 
 
 		 297 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  61.85 
 
 		 291 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  54.83 
 
 		 296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  55.36 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  54.65 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  53.33 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  53.95 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  51.2 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  54.83 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  52.01 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  54.9 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  54.41 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  53.44 
 
 		 288 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  51.54 
 
 		 289 aa  265  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  52 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  51.39 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  51.39 
 
 		 312 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  54.92 
 
 		 303 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  49.22 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  48.78 
 
 		 290 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  52.72 
 
 		 290 aa  258  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  49.81 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  51.63 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  51.22 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  51.39 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  50 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  48.25 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  50.59 
 
 		 314 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  50.21 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  50.2 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  49.79 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  50.2 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  50.2 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  50.2 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  50.2 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  50.2 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  49.64 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  49.48 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  47.62 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  43.51 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  46.46 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  46.09 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  45.6 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  45.6 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  45.6 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  47.83 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  44.05 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4082  Beta-lactamase  49.1 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  43.46 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  48.9 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  44.53 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4048  Beta-lactamase  43.97 
 
 		 314 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  42.52 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2539  beta-lactamase  42.13 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000363771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  41.83 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  43.03 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  43.03 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  43.03 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  43.03 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  48.21 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  40.32 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  41.73 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1245  Beta-lactamase  42.58 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  43.98 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  42.11 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  41.18 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  38.52 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  38.64 
 
 		 283 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  41.67 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  38.89 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3769  Beta-lactamase  44.54 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4599  Beta-lactamase  44.54 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1245  beta-lactamase  37.5 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  38.17 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4029  Beta-lactamase  43.75 
 
 		 299 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3962  Beta-lactamase  45.08 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5706  Beta-lactamase  44.49 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0394955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4487  Beta-lactamase  44.2 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  40.16 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2178  Beta-lactamase  42.51 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198919  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  41.99 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  43.78 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  41.11 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  41.11 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  41.11 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  38.85 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  40 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  32.14 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  32.14 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  32.14 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  32.14 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  30.85 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  29.72 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  28.97 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  26.98 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  25.95 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  28.35 
 
 		 418 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  27.89 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  23.67 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>