238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0085 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0085  acylphosphatase  100 
 
 		 107 aa  208  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.49451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2369  acylphosphatase  52.69 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1322  acylphosphatase  57.33 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0315179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3583  acylphosphatase  57.83 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4900  putative acylphosphatase  53.75 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3350  acylphosphatase  52.44 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3223  acylphosphatase  51.11 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.7882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2998  acylphosphatase  54.67 
 
 		 94 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.593748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3186  acylphosphatase  50.56 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  48.75 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2746  acylphosphatase  50.55 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352229  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2164  acylphosphatase  50.54 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0372  acylphosphatase  56.41 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.404855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1735  acylphosphatase  46.39 
 
 		 99 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3091  acylphosphatase  47.73 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937205  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  54.17 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  49.35 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  52.38 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1891  acylphosphatase  57.14 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1316  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0042  acylphosphatase  54.29 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2230  acylphosphatase  47.5 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.595414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2947  acylphosphatase  43.21 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2654  acylphosphatase  45.78 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.156555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3245  acylphosphatase  45.65 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3149  acylphosphatase  43.21 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000748736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3370  hypothetical protein  46.74 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4329  acylphosphatase  45.68 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.41249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  46.08 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  43.75 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3795  acylphosphatase  57.35 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.524231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3568  acylphosphatase  50 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0009  acylphosphatase  48.35 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4152  acylphosphatase  48.35 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  52 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2011  acylphosphatase  47.14 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  56.72 
 
 		 97 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1584  acylphosphatase  47.25 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3085  acylphosphatase  52.17 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.842982 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  43.42 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1716  acylphosphatase  47.25 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000101765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4711  acylphosphatase  55.84 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  47.44 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3184  acylphosphatase  47.3 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3607  acylphosphatase  44.74 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4554  acylphosphatase  52.11 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  47.44 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6189  acylphosphatase  45.95 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6574  acylphosphatase  43.82 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  46.25 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0219  putative acylphosphatase protein  51.39 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3279  acylphosphatase  50 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000800863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  51.95 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  50.75 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  45.78 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3029  acylphosphatase  48.68 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.14564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  42.22 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  46.15 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0151  acylphosphatase  42.53 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  46.25 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2680  acylphosphatase  45.83 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174548  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  45.33 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  43.33 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  44.71 
 
 		 97 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  44.3 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  44.3 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  44.3 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  44.74 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  44.3 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  48.65 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  44.3 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  44.3 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0163  acylphosphatase  35.8 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1453  acylphosphatase  46.58 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  47.37 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  44.05 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  42.5 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  42.5 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  45.98 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  53.73 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  46.25 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1505  acylphosphatase  49.33 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08420  cylphosphatase  44.93 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  50.65 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3123  acylphosphatase-like protein  47.89 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.555032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3443  acylphosphatase  40 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  40.3 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  44.44 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  45.21 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  45.21 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  41.67 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0599  acylphosphatase  36.96 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  48 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  40.24 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4846  acylphosphatase  44.59 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>