23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0079 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0079  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  202  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.554101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1450  hypothetical protein  48.6 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4612  hypothetical protein  53.06 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2456  hypothetical protein  58.14 
 
 		 103 aa  100  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2883  hypothetical protein  48.54 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3841  hypothetical protein  50.5 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1509  hypothetical protein  51.89 
 
 		 135 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0165  hypothetical protein  45.16 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00168593  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1925  hypothetical protein  46.74 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.116141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2600  hypothetical protein  47.5 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0410  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4594  hypothetical protein  48.31 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1970  hypothetical protein  51.65 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2246  hypothetical protein  51.65 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0399381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1356  hypothetical protein  39.47 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2050  hypothetical protein  47.69 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0062  hypothetical protein  54.43 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1665  hypothetical protein  56.82 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0627  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00327781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3695  hypothetical protein  43.28 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0590  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0603  hypothetical protein  48.81 
 
 		 148 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1903  hypothetical protein  57.78 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0124383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>