18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0054 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0054  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.679685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3585  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0669  hypothetical protein  38.1 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0695  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.738564  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0706  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  116  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.014911  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1123  hypothetical protein  38 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6732  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6520  hypothetical protein  36.73 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1695  hypothetical protein  33.99 
 
 
149 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.305902  normal  0.0330164 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4181  hypothetical protein  35.14 
 
 
179 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.922786  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1127  hypothetical protein  34.46 
 
 
175 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1031  hypothetical protein  34.46 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0267  hypothetical protein  32 
 
 
161 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1155  hypothetical protein  29.05 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0778  hypothetical protein  28.38 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0350  hypothetical protein  27.15 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.686615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0382  hypothetical protein  25.83 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183982  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0288  hypothetical protein  28.1 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>