254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0047 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0047  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
135 aa  257  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3552  flagellar basal body rod modification protein  68.18 
 
 
141 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1134  flagellar basal body rod modification protein  55.86 
 
 
137 aa  124  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23368  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1039  flagellar basal body rod modification protein  55.86 
 
 
137 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4188  flagellar basal body rod modification protein  54.95 
 
 
136 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6511  flagellar basal body rod modification protein  52.99 
 
 
142 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0274  flagellar basal body rod modification protein  46.51 
 
 
129 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1116  flagellar basal body rod modification protein  55.56 
 
 
135 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0281  flagellar basal body rod modification protein  43.48 
 
 
138 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0375  flagellar basal body rod modification protein  49.55 
 
 
144 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118719  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0662  flagellar basal body rod modification protein  52.88 
 
 
138 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.25613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0688  flagellar basal body rod modification protein  51.92 
 
 
138 aa  100  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136658  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0699  flagellar basal body rod modification protein  51.92 
 
 
138 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608637  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1702  flagellar basal body rod modification protein  46.3 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0769  flagellar basal body rod modification protein  47.27 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0343  flagellar basal body rod modification protein  44.85 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.644683 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1117  flagellar hook capping protein  42.86 
 
 
190 aa  85.5  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  49.51 
 
 
228 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0694  flagellar hook capping protein  38.89 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144409  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  46.81 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4207  flagellar basal body rod modification protein  43.33 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  38.1 
 
 
245 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  48.84 
 
 
226 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0073  flagellar hook capping protein  32.62 
 
 
219 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  48.84 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1336  flagellar basal body rod modification protein  42.7 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0005  flagellar basal body rod modification protein  42.7 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  49.33 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  55.93 
 
 
253 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  45.74 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0144  flagellar hook capping protein  42.55 
 
 
159 aa  67  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  45.59 
 
 
218 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  36.79 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16820  flagellar hook capping protein  33.63 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.274854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  53.7 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0067  flagellar hook capping protein  38.14 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0752  flagellar hook capping protein  34.33 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.966929  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1686  flagellar hook capping protein  38.83 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2010  flagellar basal body rod modification protein  38.24 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2978  flagellar basal body rod modification protein  50.85 
 
 
231 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150885  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 
229 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2044  flagellar hook capping protein  39.77 
 
 
285 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4125  flagellar hook capping protein  33.61 
 
 
184 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  66.67 
 
 
222 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  37.11 
 
 
218 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1657  flagellar hook capping protein  40.83 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.130942  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  45.83 
 
 
232 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0472  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 
323 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  36.56 
 
 
229 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2402  flagellar hook capping protein  31.48 
 
 
185 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.78 
 
 
238 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1396  flagellar hook capping protein  38.38 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3649  flagellar hook capping protein  38.82 
 
 
220 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0856  flagellar hook capping protein-like protein  32.11 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  34.95 
 
 
237 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3969  flagellar hook capping protein  38.71 
 
 
220 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  41.03 
 
 
218 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1118  flagellar basal body rod modification protein  31 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  48.08 
 
 
221 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  39.36 
 
 
235 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  48.08 
 
 
221 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  36.75 
 
 
218 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3466  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 
220 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2277  flagellar hook capping protein  30.7 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  46.15 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  35.24 
 
 
265 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0048  flagellar hook capping protein  34.29 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  35.85 
 
 
220 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  39.44 
 
 
226 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2769  flagellar basal body rod modification protein  39.39 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.225291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  50 
 
 
227 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  34.41 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  55 
 
 
221 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  43.86 
 
 
230 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  35.77 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  41.54 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  39.18 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1260  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
284 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0777  flagellar hook capping protein  37.04 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0403278  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  39.18 
 
 
225 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  39.18 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  42.39 
 
 
248 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  42.39 
 
 
248 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  44.29 
 
 
220 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  39.44 
 
 
235 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
294 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1759  flagellar hook capping protein  29.2 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 
277 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 
280 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  36.46 
 
 
235 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  42.25 
 
 
215 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 
277 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  34.83 
 
 
294 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2710  flagellar hook capping protein  37.35 
 
 
275 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3365  flagellar basal body rod modification protein  46.67 
 
 
220 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 
277 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  42.25 
 
 
215 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 
280 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  40.62 
 
 
277 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>