More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0042 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 414 aa  805    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  63.37 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  49.77 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  49.77 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  46.68 
 
 		 422 aa  352  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  50.83 
 
 		 411 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  46.31 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  45.11 
 
 		 426 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  46.56 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  44.83 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  44.23 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  44.58 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  47.26 
 
 		 407 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  46.48 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  43.78 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  42.65 
 
 		 411 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  43.91 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  44.15 
 
 		 403 aa  299  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  42.31 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  33.95 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  34.95 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.39 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  31.39 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  32.54 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.85 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  32.71 
 
 		 413 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.87 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  29.22 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.87 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  34.69 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  32.75 
 
 		 461 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  34.77 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  32.64 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  33.17 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  33.79 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  34.2 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.2 
 
 		 402 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  32.93 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  32.93 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  30.64 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  34.29 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  31.98 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.75 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  31.5 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  32.6 
 
 		 401 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  34.44 
 
 		 404 aa  163  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  33.56 
 
 		 419 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  30.93 
 
 		 398 aa  163  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  33.98 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  30.59 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  31.33 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  31.33 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  31.33 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.46 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  31.33 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  31.33 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  32.04 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30.32 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  34.55 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  30.46 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  30.81 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.74 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  30.29 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  30.58 
 
 		 404 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  30.99 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  30.99 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30.99 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  29.95 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  32.11 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  30.51 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  31.08 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.88 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  34.1 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  33.64 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  30.27 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  31.37 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  30.1 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.23 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  30.54 
 
 		 438 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  29.52 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.12 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  30.8 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  29.77 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.14 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  29.71 
 
 		 465 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  29.71 
 
 		 465 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  29.04 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  29.04 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  29.04 
 
 		 428 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  29.3 
 
 		 394 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  30.53 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>