More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0037 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0037  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
402 aa  817    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2687  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 
416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.826191  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1679  OmpA/MotB domain-containing protein  43.73 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0303068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1107  flagellar motor protein MotB  40.93 
 
 
423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4198  flagellar motor protein MotB  39.55 
 
 
371 aa  249  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0284  flagellar motor protein MotB  38.21 
 
 
452 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  38.34 
 
 
441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1144  flagellar motor protein MotB  38 
 
 
366 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0271  flagellar motor protein MotB  39.02 
 
 
397 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0757415  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0333  flagellar motor protein MotB  35.92 
 
 
447 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0365  flagellar motor protein MotB  36.12 
 
 
443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0756  flagellar motor protein MotB  36.75 
 
 
444 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1127  putative flagellar motor protein MotB  34.33 
 
 
357 aa  205  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0610  OmpA/MotB domain protein  55.36 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0096444  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0631  OmpA/MotB domain-containing protein  55.7 
 
 
468 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  0.662195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0642  OmpA/MotB domain protein  55.7 
 
 
462 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0469396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  39.2 
 
 
371 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
346 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  37.5 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 
306 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  33.15 
 
 
305 aa  86.7  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0275  hypothetical protein  33.06 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  37.82 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.47 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  42.34 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  33.06 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3377  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  33.06 
 
 
307 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0264  hypothetical protein  32.26 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0258  hypothetical protein  32.26 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  33.87 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  36 
 
 
303 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  36 
 
 
303 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  35.77 
 
 
312 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  36.36 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  34.09 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  35.77 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3437  flagellar motor protein  34.85 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1682  putative chemotaxis MotB protein  34.85 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297194  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  34.01 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  34.85 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  49.28 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  34.85 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  34.85 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  34.85 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3453  OmpA/MotB domain protein  48.57 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  34.27 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  35.2 
 
 
303 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  33.87 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.07 
 
 
264 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  38.05 
 
 
329 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  34.27 
 
 
339 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  26.07 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  53.62 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  55.07 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  44.32 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  40.57 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  39.83 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  41.76 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  44.32 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  43.75 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  43.75 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  37.5 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  44.83 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  33.86 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  37.5 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  37.5 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  51.67 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  55.93 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  41.76 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  43.18 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  33.86 
 
 
298 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  33.86 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  52.17 
 
 
312 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  33.33 
 
 
296 aa  77  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  36.51 
 
 
287 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  53.62 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 
301 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  46.38 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  46.38 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  46.38 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  37.84 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  39.25 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  39.25 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  52.24 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  51.67 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0154  chemotaxis lafU protein  33.83 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  33.59 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  31.61 
 
 
316 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  48.48 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0202  chemotaxis LafU protein  33.83 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 
321 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>