216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0029 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 367 aa  729    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  69.13 
 
 		 370 aa  505  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  65.22 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  60.78 
 
 		 375 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  60.5 
 
 		 377 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  60.5 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  59.94 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  62.12 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  56.4 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  56.51 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  55.75 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  56.03 
 
 		 413 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  56.4 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  53.39 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  54.76 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  55.23 
 
 		 371 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  53.7 
 
 		 380 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  53.7 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  55.78 
 
 		 378 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  52.09 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  50.94 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  53.31 
 
 		 371 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  53.24 
 
 		 377 aa  342  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  51.87 
 
 		 374 aa  342  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  51.57 
 
 		 373 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  51.14 
 
 		 378 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  50.99 
 
 		 373 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  53.42 
 
 		 376 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  51.16 
 
 		 373 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  48.76 
 
 		 371 aa  328  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  49.86 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  51.56 
 
 		 374 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  48.9 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  50.72 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  47.15 
 
 		 366 aa  318  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  48.49 
 
 		 386 aa  316  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  46.63 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  46.47 
 
 		 370 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  48.22 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  45.18 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 367 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  47.41 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  46.97 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  48.34 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  47.3 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  47.45 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  47.3 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  47.24 
 
 		 363 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  46.52 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  45.78 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  48.99 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 		 398 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  47.11 
 
 		 398 aa  289  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  47.67 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.16 
 
 		 401 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.09 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  45.36 
 
 		 380 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3155  flagellar basal body P-ring protein  47.55 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.60155  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  44.84 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  45.36 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  45.45 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  45.36 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  45.23 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  46.3 
 
 		 392 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  44.44 
 
 		 392 aa  278  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  44.62 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  44.3 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  47.13 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  46.7 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  42.31 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  45.38 
 
 		 368 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  46.57 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  46.57 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  45.25 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  45.98 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  42.7 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  43.36 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  41.78 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  42.44 
 
 		 391 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  42.94 
 
 		 386 aa  269  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 401 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 400 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 400 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  42.44 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  42.44 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  44.41 
 
 		 363 aa  268  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  42.36 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  43.73 
 
 		 377 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  43.17 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  43.17 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  44.13 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  42.55 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  44.38 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  43.36 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>