More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0027 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0027  flagellar basal body rod protein FlgG  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3653  flagellar basal body rod protein FlgG  79.39 
 
 
262 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  68.58 
 
 
262 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 
262 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  66.28 
 
 
262 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 
262 aa  359  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  66.67 
 
 
262 aa  359  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  67.05 
 
 
262 aa  358  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  65.9 
 
 
262 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  64.75 
 
 
262 aa  348  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  64.75 
 
 
262 aa  348  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  64.75 
 
 
262 aa  347  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1689  flagellar basal body rod protein FlgG  62.84 
 
 
262 aa  341  8e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  63.22 
 
 
262 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  62.07 
 
 
262 aa  337  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1141  flagellar basal body rod protein FlgG  54.02 
 
 
264 aa  296  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0740  flagellar basal-body rod protein  54.58 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2561  flagellar basal body rod protein FlgG  53.64 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.279353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.6 
 
 
263 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1431  flagellar basal body rod protein FlgG  55.43 
 
 
262 aa  279  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  55.21 
 
 
263 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  52.12 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0594  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.59 
 
 
262 aa  262  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2843  flagellar basal body rod protein FlgG  52.9 
 
 
261 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3476  flagellar basal body rod protein FlgG  53.1 
 
 
262 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.109253  normal  0.202824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.74 
 
 
263 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.74 
 
 
263 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1947  flagellar basal body rod protein FlgG  51.78 
 
 
261 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  51.74 
 
 
263 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  49.22 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 
261 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2605  flagellar basal body rod protein FlgG  50.2 
 
 
261 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.772523  hitchhiker  0.000534608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 
261 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4295  flagellar basal body rod protein FlgG  49.04 
 
 
261 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  49.81 
 
 
261 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50430  flagellar basal body rod protein FlgG  49.04 
 
 
261 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3051  flagellar basal body rod protein FlgG  46.64 
 
 
262 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2845  flagellar basal body rod protein FlgG  48.28 
 
 
261 aa  245  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.288565  normal  0.0904006 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1506  flagellar basal body rod protein FlgG  49.22 
 
 
262 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.66 
 
 
263 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3252  flagellar basal body rod protein FlgG  47.1 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  47.89 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1326  flagellar basal body rod protein FlgG  48.26 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  48.44 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  47.27 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1940  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.85 
 
 
262 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3475  flagellar basal body rod protein FlgG  48.85 
 
 
262 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16570  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.08 
 
 
262 aa  241  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2987  flagellar basal body rod protein FlgG  48.26 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3787  flagellar basal body rod protein FlgG  48.84 
 
 
262 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0961005  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4193  flagellar basal body rod protein FlgG  48.22 
 
 
261 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  49.61 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1383  flagellar basal body rod protein FlgG  49.22 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2960  flagellar basal body rod protein FlgG  47.88 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4423  flagellar basal body rod protein FlgG  48.06 
 
 
262 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  49.21 
 
 
261 aa  237  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.1 
 
 
261 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3762  flagellar basal body rod protein FlgG  47.43 
 
 
262 aa  236  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1530  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.83 
 
 
260 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.248852  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.22 
 
 
260 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1771  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.06 
 
 
261 aa  236  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  48.06 
 
 
261 aa  236  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.33 
 
 
260 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.33 
 
 
260 aa  235  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  46.61 
 
 
261 aa  234  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  47.04 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.1 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.1 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2233  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.49 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.837923  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  49.41 
 
 
262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1558  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.64 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  46.64 
 
 
260 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3846  flagellar basal body rod protein FlgG  46.64 
 
 
262 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000536621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1683  flagellar basal body rod protein FlgG  46.9 
 
 
262 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.082538 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.43 
 
 
262 aa  232  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3789  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2729  flagellar basal-body rod protein FlgG  47.43 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000014891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  48.22 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3966  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.67 
 
 
261 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0145  flagellar basal body rod protein FlgG  47.29 
 
 
262 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0898  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.95 
 
 
261 aa  231  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5510  flagellar basal body rod protein FlgG  48.62 
 
 
262 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  0.858095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3463  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.28 
 
 
261 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0431  flagellar basal body rod protein FlgG  42.97 
 
 
262 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  44.02 
 
 
261 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2518  flagellar basal body rod protein FlgG  47.66 
 
 
260 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0564  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.17 
 
 
260 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2115  flagellar basal body rod protein FlgG  46.09 
 
 
261 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.95 
 
 
260 aa  229  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2193  flagellar basal body rod protein FlgG  45.85 
 
 
260 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000524938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3281  flagellar basal body rod protein FlgG  45.06 
 
 
262 aa  229  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  45.77 
 
 
262 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  43.63 
 
 
261 aa  228  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0070  flagellar basal-body rod protein FlgG  45.82 
 
 
261 aa  228  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0242  flagellar basal body rod protein FlgG  45.74 
 
 
262 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  46.51 
 
 
261 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2420  flagellar basal body rod protein FlgG  46.25 
 
 
260 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.298468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2319  flagellar basal body rod protein FlgG  46.25 
 
 
260 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>