36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0026 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 104 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  49.19 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.43 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.43 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  66.67 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.33 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  58.54 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  55.71 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  57.75 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  56.34 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  54.93 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  49.28 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  47.13 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  42.42 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  45.98 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  48.1 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  39.13 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.42 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.57 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.71 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  37.68 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  34.44 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  34.44 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.61 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.14 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.94 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  29.67 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.44 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  29.76 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  37.8 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>