90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0024 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
126 aa  257  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  52.8 
 
 
126 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  52.34 
 
 
126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  50 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  50.79 
 
 
125 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  49.21 
 
 
126 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  48.8 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  47.29 
 
 
130 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  47.97 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  47.97 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  47.29 
 
 
130 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  45.6 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  44.88 
 
 
126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  42.4 
 
 
127 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  44.53 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  43.65 
 
 
128 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  43.85 
 
 
130 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.36 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  37.14 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  35.11 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  32.52 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  33.88 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  36.08 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  39.25 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  33.83 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  32.09 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  32.59 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  33.06 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  30.88 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  29.84 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  44.68 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  36.56 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1768  flagellar basal-body rod protein FlgB  40.23 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.144654  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.98 
 
 
152 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  31.53 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3841  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.9 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.32 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3925  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.78 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  30.77 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.58 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2411  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.1 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  28.69 
 
 
126 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  30.53 
 
 
135 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  35.35 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0685  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.21 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1340  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.06 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  31.18 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.48 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.67 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  32.77 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  22.22 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  22.22 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.67 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.38 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3636  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1763  flagellar basal body rod protein FlgB  25.69 
 
 
135 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.91 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1741  flagellar basal body rod protein FlgB  26.67 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1520  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1531  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1557  flagellar basal body rod protein FlgB  26.67 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.371547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1674  flagellar basal body rod protein FlgB  26.67 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1709  flagellar basal body rod protein FlgB  26.36 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1819  flagellar basal body rod protein FlgB  25.69 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0768  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.99 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1714  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.1 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000396708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3307  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.33 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1108  flagellar basal body rod protein FlgB  28.87 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00049744  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  23.49 
 
 
165 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0365  flagellar basal body rod protein FlgB  30.69 
 
 
143 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  28.81 
 
 
135 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.05 
 
 
144 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4216  flagellar basal-body rod protein FlgB  36.36 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  27.37 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2047  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.52 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.86 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.27 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0838  flagellar basal-body rod protein  30.56 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5625  flagellar basal body rod protein FlgB  25.22 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.56 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0569  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.82 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1560  flagellar basal body rod protein FlgB  27.27 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  24.14 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  24.14 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1271  flagellar basal-body rod protein FlgB  27.42 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232017  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  24.14 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  24.14 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  24.14 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2734  flagellar basal-body rod protein FlgB  24.8 
 
 
134 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000288784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>