187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0019 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 
314 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  58.47 
 
 
313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  48.66 
 
 
309 aa  316  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  48 
 
 
311 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  45.97 
 
 
303 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.71 
 
 
340 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  46.71 
 
 
344 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  45.67 
 
 
335 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 
384 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  27.59 
 
 
376 aa  135  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  26.45 
 
 
404 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  27.42 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  27.09 
 
 
405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  27.42 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 
374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  28.06 
 
 
403 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  26.23 
 
 
403 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  28.42 
 
 
395 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  26.95 
 
 
401 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  25.52 
 
 
377 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  26.6 
 
 
401 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  25.34 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  28.42 
 
 
337 aa  119  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  25.34 
 
 
404 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  25.34 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  26.6 
 
 
401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  26.24 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  25.8 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  24.25 
 
 
335 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  24.25 
 
 
335 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  23.72 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.16 
 
 
317 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  24.14 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  22.99 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  24.54 
 
 
324 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  23.79 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
332 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
332 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
332 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  23.38 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  24.14 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  25.95 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  23.93 
 
 
335 aa  87  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
332 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  23.63 
 
 
336 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  23.26 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  23.26 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  23.26 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  23.43 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  22.99 
 
 
332 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  23.43 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  24 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  23.97 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  22.95 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  22.99 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  19.6 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  23.1 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  22.11 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  21.9 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  21.2 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  23.1 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  21.55 
 
 
341 aa  79  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  21.3 
 
 
342 aa  79  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  20.78 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  22.48 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  25.98 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  25.98 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  22.46 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  20.49 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  24.19 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  20.14 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  20.49 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  22.46 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  20.49 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  24.48 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  20.85 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
395 aa  75.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  22.11 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  22.1 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  20.14 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  20.14 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  20.49 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  20.14 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  20.49 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  22.34 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  20.14 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  22.74 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  22.63 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  21.92 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  22.46 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  22.83 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  19.43 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>