More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0008 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 328 aa  655    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  67.3 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  63.61 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  63.11 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  63 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  66.23 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  65.12 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  59.38 
 
 		 323 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  64.21 
 
 		 328 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  62.13 
 
 		 335 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.68 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  59.02 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  59.67 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  59.14 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  57.46 
 
 		 329 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.46 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  56.92 
 
 		 329 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  54.24 
 
 		 334 aa  357  9.999999999999999e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.01 
 
 		 321 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.43 
 
 		 329 aa  351  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  53.54 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  56.52 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  54.46 
 
 		 329 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  54.88 
 
 		 327 aa  341  8e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.62 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0484  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  52.75 
 
 		 323 aa  335  5.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  53.8 
 
 		 362 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.23 
 
 		 324 aa  335  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  53.87 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  52.49 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  51.44 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.28 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  44.3 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  42.86 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.24 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.67 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.68 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.54 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.58 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.71 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.25 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.6 
 
 		 689 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.22 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  32.87 
 
 		 580 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  33.01 
 
 		 387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.32 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1667 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.01 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.61 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  32.32 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.66 
 
 		 810 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.32 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.62 
 
 		 1094 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.26 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.61 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.48 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  29.87 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.85 
 
 		 752 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.54 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  30.03 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5421  WD-40 repeat-containing protein  28.16 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.56 
 
 		 819 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  31.86 
 
 		 479 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1170 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.94 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.54 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.65 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  31.13 
 
 		 556 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2474  hypothetical protein  28 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.686605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 		 776 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.3 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.42 
 
 		 365 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.98 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.66 
 
 		 415 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.31 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1302  hypothetical protein  28.48 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.127226  normal  0.259109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.62 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.96 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  31.02 
 
 		 971 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.77 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.48 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.48 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.48 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.48 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.69 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.48 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.81 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.12 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.77 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.02 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  27.42 
 
 		 1189 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.28 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  28.98 
 
 		 250 aa  99.8  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.43 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.5 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.85 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.57 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.24 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.1 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>