50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0007 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  839    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  62.93 
 
 		 400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  55.68 
 
 		 395 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  52.81 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  51.59 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  51.06 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  51.76 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  49.74 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  47.99 
 
 		 420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  45.55 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  47.98 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  47.69 
 
 		 422 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  42.38 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  42.86 
 
 		 424 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  45.77 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  45.61 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  41.76 
 
 		 423 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  43.77 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  39.49 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  40.53 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.4 
 
 		 391 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  43.36 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  43.47 
 
 		 400 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  42.2 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  40.91 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  40.37 
 
 		 408 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  40.37 
 
 		 408 aa  279  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  38 
 
 		 416 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  43.2 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  41.62 
 
 		 402 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  37.35 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  37.04 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  34.5 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  31.99 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  34.69 
 
 		 391 aa  162  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  22.34 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  21.71 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  21.47 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  21.2 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3518  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.36456 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  23.03 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  22.63 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3119  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  24.49 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5162  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  26.42 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0057  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2465  Extracellular ligand-binding receptor  26.07 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1793  hypothetical protein  25.83 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0949  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.07 
 
 		 399 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>