32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0006 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.25 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.59 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.24 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.3 
 
 		 262 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.06 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.99 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  34.15 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  32.92 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.29 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.88 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.24 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.37 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.2 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  29.83 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  29.83 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.07 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.1 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  32.35 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  21.9 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  28.92 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.06 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  30.08 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  30.65 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.34 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  26.16 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.22 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.4 
 
 		 734 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1890  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.54 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.88 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>