13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0005 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0005    100 
 
 		 945 bp  1873    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 951 bp  58  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2876  porphobilinogen deaminase  85.29 
 
 		 948 bp  56  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 1044 bp  56  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  96.88 
 
 		 930 bp  56  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0007  porphobilinogen deaminase  92.31 
 
 		 1014 bp  54  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0795  chaperonin GroEL  100 
 
 		 1644 bp  52  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  93.94 
 
 		 930 bp  50.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  93.94 
 
 		 942 bp  50.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  96.55 
 
 		 993 bp  50.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  88.89 
 
 		 930 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3965  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1662 bp  48.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0975175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  93.75 
 
 		 957 bp  48.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>