29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0001 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.526231  decreased coverage  0.00115585 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0017  tRNA-Thr  89.77 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0552891  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0023  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0022  tRNA-Arg  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0022  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.285204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0032  tRNA-Asp  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0043  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.925316 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0003  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0022  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.243573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0053  tRNA-Asp  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0012  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571236  normal  0.0197692 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0031  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0723333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0048  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0027  tRNA-His  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000556999  normal  0.160274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0006  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0029  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.499357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0004  tRNA-Val  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000000388109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3268  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3265  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3264  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3262  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.733644  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>