More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2277 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2277  small GTP-binding protein  100 
 
 		 350 aa  706    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.92801  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1246  GTP-binding proten HflX  58.91 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  35.99 
 
 		 372 aa  202  9e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  36.9 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  36.42 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  35.52 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  35.82 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  34.63 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  33.52 
 
 		 461 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  34.26 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  33.98 
 
 		 454 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  37.5 
 
 		 424 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  33.97 
 
 		 436 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  31.71 
 
 		 512 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  34.42 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  35 
 
 		 503 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  35.4 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  35.99 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  33.85 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  35.95 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  35 
 
 		 482 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  34.78 
 
 		 564 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  34.78 
 
 		 564 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  33.72 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  34.43 
 
 		 574 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  35.57 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  32.29 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  33.15 
 
 		 501 aa  150  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  32.49 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  31.83 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  34.12 
 
 		 380 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  31.69 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  33.22 
 
 		 437 aa  149  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  33.43 
 
 		 413 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  36.3 
 
 		 413 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  31.4 
 
 		 450 aa  149  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  35.4 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  35.41 
 
 		 512 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  35.5 
 
 		 485 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  35.09 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  33.44 
 
 		 519 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  33.04 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  33.15 
 
 		 434 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1212  GTP-binding proten HflX  34.38 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  33.52 
 
 		 509 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  33.71 
 
 		 421 aa  146  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  32.02 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  32.51 
 
 		 403 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  32.95 
 
 		 436 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  33.33 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  31.83 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  30.59 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  30.45 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  32.79 
 
 		 583 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  32.6 
 
 		 396 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  33.91 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  33.97 
 
 		 419 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  32.94 
 
 		 502 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  34.32 
 
 		 432 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  33.62 
 
 		 421 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  33.33 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  33.81 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  33.53 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  33.14 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  33.53 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  33.05 
 
 		 509 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  33.77 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  32.32 
 
 		 528 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  33.23 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  32.3 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  34.32 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  33.13 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  32.26 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  35.26 
 
 		 436 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  35.45 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  35.43 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  34.11 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  32.61 
 
 		 435 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  34.08 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  34.03 
 
 		 596 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  33.23 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  33.23 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  33.11 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  31.44 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  34.1 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  35.22 
 
 		 419 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  34.1 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  31.86 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  33.01 
 
 		 469 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  34.1 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  34.1 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  31.65 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  32.76 
 
 		 515 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  34.1 
 
 		 387 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  35.1 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2448  GTP-binding protein HflX  32.89 
 
 		 535 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  33.23 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3023  GTP-binding proten HflX  32.8 
 
 		 540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  32.78 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>