25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2273 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2273  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  491  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222464  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1250  protein of unknown function DUF75  58.51 
 
 
240 aa  321  8e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  31.11 
 
 
247 aa  115  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0034  hypothetical protein  32.21 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0031  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00817392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2148  hypothetical protein  31.73 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  26.61 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  28.1 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1073  hypothetical protein  31.73 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  27.98 
 
 
267 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  22.88 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  22.83 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  27.4 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  22.42 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  26.48 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  26.48 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  24.77 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  21.24 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  24.22 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  24.56 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  20.6 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  19.91 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  23.91 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  36.17 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  21.72 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>