More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2254 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  76.22 
 
 		 635 aa  975    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 642 aa  1298    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  47.71 
 
 		 637 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  47.6 
 
 		 635 aa  615  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  47.06 
 
 		 636 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  46.47 
 
 		 635 aa  592  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  46.5 
 
 		 629 aa  592  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  45.95 
 
 		 630 aa  589  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  46.47 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  46.31 
 
 		 635 aa  588  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  46.5 
 
 		 635 aa  590  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  44.48 
 
 		 644 aa  587  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  45.56 
 
 		 641 aa  585  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  46.92 
 
 		 630 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  46.81 
 
 		 639 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  46.61 
 
 		 639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  45.09 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  44.23 
 
 		 644 aa  580  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  43.58 
 
 		 641 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  45.59 
 
 		 636 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  43.59 
 
 		 640 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  43.94 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  45.25 
 
 		 646 aa  560  1e-158  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  44.3 
 
 		 636 aa  525  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  43.32 
 
 		 634 aa  527  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  44.87 
 
 		 635 aa  503  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  44.21 
 
 		 640 aa  500  1e-140  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  43.43 
 
 		 634 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  43.13 
 
 		 634 aa  472  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 		 426 aa  280  7e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  37.71 
 
 		 422 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  37.71 
 
 		 422 aa  273  9e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  37.47 
 
 		 422 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 		 421 aa  251  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  32.15 
 
 		 468 aa  223  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 425 aa  219  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.77 
 
 		 543 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 821 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  32.04 
 
 		 541 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  29.78 
 
 		 767 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  30.44 
 
 		 467 aa  211  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 536 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  34.5 
 
 		 433 aa  210  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  29.81 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  30.67 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  30.97 
 
 		 470 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  34.42 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 547 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 		 425 aa  204  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 525 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  30.04 
 
 		 466 aa  201  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  32.33 
 
 		 570 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  31.51 
 
 		 467 aa  201  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 		 433 aa  200  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.12 
 
 		 540 aa  200  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 		 453 aa  200  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 		 430 aa  198  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  33.79 
 
 		 411 aa  197  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  29.92 
 
 		 455 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 432 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  31.19 
 
 		 411 aa  196  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  30.74 
 
 		 460 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.66 
 
 		 465 aa  194  5e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 421 aa  194  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 830 aa  193  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.69 
 
 		 470 aa  193  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.85 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 		 464 aa  192  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02710  hypothetical protein  28.81 
 
 		 773 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  30.34 
 
 		 544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  33.77 
 
 		 485 aa  191  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  30.6 
 
 		 476 aa  191  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 455 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  31.31 
 
 		 452 aa  190  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  31.44 
 
 		 465 aa  190  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  33.73 
 
 		 422 aa  190  7e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.56 
 
 		 474 aa  190  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  29.96 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  32.08 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  31.03 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  29.66 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 535 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  31.26 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  28.38 
 
 		 470 aa  188  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  29.89 
 
 		 468 aa  188  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  28.16 
 
 		 535 aa  188  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001774  metallo-beta-lactamase family protein RNA-specific  31.57 
 
 		 441 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 452 aa  188  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  29.17 
 
 		 468 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  32.3 
 
 		 422 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  29.31 
 
 		 452 aa  187  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>