10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2179 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2179  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.54958  hitchhiker  0.000254205 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1430  conserved hypothetical protein  68.45 
 
 
223 aa  293  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1695  Snf7  65 
 
 
221 aa  275  5e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.338285 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1866  conserved hypothetical protein  66.5 
 
 
221 aa  259  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0061  hypothetical protein  39.3 
 
 
216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1891  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 
259 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.522365  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1671  hypothetical protein  35.63 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000972701  normal  0.698741 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0816  SNF7 protein  32.82 
 
 
216 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.283391 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0029  hypothetical protein  34.47 
 
 
215 aa  102  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1969  hypothetical protein  26.24 
 
 
165 aa  41.6  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>