47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2169 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2169  peptidase M50  100 
 
 
203 aa  396  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000408373 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1442  peptidase M50  53.47 
 
 
201 aa  170  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1153  peptidase M50  35.08 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.41947  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0058  peptidase M50  34.34 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643097  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0055  hypothetical protein  33.73 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0133021 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0765  peptidase M50  33.33 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.249654  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1924  peptidase M50  34.72 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.434385  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  30.85 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0242  peptidase M50  36.73 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0075  peptidase M50  34.18 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0470  peptidase M50  38.82 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0156  peptidase M50  33.91 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3812  peptidase M50  32.48 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1308  peptidase M50  34.43 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141861  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0990  peptidase M50  32.05 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2536  peptidase M50  35.21 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  36.81 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0909  peptidase M50  39.42 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.470525  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2747  peptidase M50  29.88 
 
 
213 aa  58.9  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0691  peptidase M50  30.27 
 
 
208 aa  58.2  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00130095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0861  peptidase M50  27.55 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1987  peptidase M50  31.21 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0435  peptidase M50  29.49 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1021  peptidase M50  28.47 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  35.37 
 
 
290 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1456  peptidase M50  32.21 
 
 
292 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3494  peptidase M50  31.1 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0928  peptidase M50  32.98 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.882812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0775  peptidase M50  37.33 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1624  peptidase M50  29.87 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  30.47 
 
 
338 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  41.33 
 
 
376 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  30.47 
 
 
342 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  32.84 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  27.08 
 
 
375 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  29.69 
 
 
337 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  33.06 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  27.27 
 
 
373 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.09 
 
 
388 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  28.91 
 
 
372 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  29.2 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  31.54 
 
 
372 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  33.33 
 
 
405 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  31.65 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  30.32 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  31.52 
 
 
359 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  31.01 
 
 
413 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>